建設
始建於一八八五年，是由在新疆抗擊沙俄為大清國立下赫赫戰功的車巴溝石礦村人貢噶堅贊，也叫棍噶扎勒參或嘉穆巴圖多普（即第一世喇嘛噶繞倉），在布達拉宮請示十二世紀達賴喇嘛土登加措後，諭示先於彼地建丁科扎倉（時輪學院），後再漸次建立其他扎倉，各靜修院合併入內，並給丁科扎倉賜名“德欽曲林”的基礎上逐步擴建統一其他各扎倉而成的一座頗具規模的藏傳佛教寺院。
清末，由羅桑卻丹主持教務，將寺院獻於拉卜楞寺，成為拉卜楞寺的一百零八座屬寺之一。至此後教權歸屬拉卜楞寺，由拉卜楞寺任命法台，處理教務。但所屬教民和教區的政務，仍由卓尼楊土司管轄，楊土司委任轄區的旗長和總管等行政官員。而財政大權依賴洮州廳，由臨潭縣掌握，一九一七年以前洮州廳每年給該寺僧人供糧七十二石。
歷史
一八八五年四月十七日，寺院為當朝皇帝皇太后祝壽，舉行了隆重的法事活動，之後遵照達賴喇嘛的諭示開工修建了有三百零六根柱子的丁科扎倉（即時輪學院）又稱德欽曲林。一八八八年二月剌嘛噶繞由拉薩抵達北京，向朝廷稟報為祝賀光緒皇帝之母（慈禧太后）六十壽誕而修建廷壽寺。皇上聞奏大悅頒賜了“當今皇帝萬歲！萬萬歲”的長生牌位和“皇太后萬歲！萬萬歲”的長生牌位及寺院的匾額、金字、旗表和白銀五千兩，大壽的誥封金冊等豐富的賞賜。四月二十二日，德欽林上下兩院業已竣工，皇帝頒賜“萬壽寺”之名。為此溝內上下兩旗的十二座靜修院連同新建的萬壽寺舉行了隆重的為大清皇帝和皇太后祝壽的法事活動。
一八八九年三月，萬壽寺建立了單純的獨立儀軌，隨之將溝內的江車靜修院扎西謝珠林、嘉地傲寺扎西曲培林、嘎察靜修院扎西桑丹林、英架察靜修院彭措曲派林、雅都靜修院扎西彭措林、石礦靜修院嘎丹謝殊林、郭察靜修院達吉曲培林、瑪爾察靜修院嘎丹曲培林、道告靜修院彭措達吉林、隆那代嘎推桑達爾吉林、肖吾靜修院益嘎彭措林、大噶靜修院等十二個靜修院與萬壽寺合併統一，統稱為扎西欽庫林（具喜吉祥法輪洲）。並於從一八九0年正月初八日起開創舉行神變節祈願法會的規則。一八九0年二月新建了有三百六十根柱子的參尼扎倉（聞思學院），八十四根柱子的曼巴扎倉（醫藥學院）和八十六根柱子的居巴扎倉（續部學院），並給僧人劃分宅基地，給各扎倉劃分土地，為修建扎西欽庫林靜修院舉行相地儀軌。一八九三年，參尼、曼巴、居巴等三個扎倉的經堂建成竣工，舉行了隆重的慶典儀式。
一九一八年應車巴溝僧侶民眾的邀請，拉卜楞寺著名佛學大師拉科·普美赤列加措足蓮這座寺院，為新轉世的第三世喇嘛噶饒倉受戒賜名，多時駐賜這座寺院資助喇嘛噶饒興建寺院，扶持其護理寺院。民國晚年拉考大師在這座寺院講經傳法，著書立說，撰寫了大量的著作，由這座寺院木刻成版，集為八函的《拉考仁波且（大師）文集》，由這座寺院印刷發行。
一九八0年十月十五日獲準重新修建。一九八二年十月十二日至十三日十世班禪足蓮這座寺院，進行加持和摸頂賜福。一九八三年建成喇嘛噶繞納欽下院，一九八四年十月十五日釋迦牟尼佛殿竣工，一九八八年七月四日，省佛協考察組嘉木樣大師、釋融開法師等蒞臨這座伽藍，宣傳宗教政策。一九九0年完成了醫藥學院的經堂竣工，翌年又建成了時輪學院的經堂，一九九四年建成密宗經堂，同時陸續重建了熱旦加措活佛的寢宮，賽藏活佛的寢宮和肖吾倉宗周加措活佛的寢宮。一九九八年在喇嘛噶繞活佛的倡導下，修建了寺內的四座小菩提寶塔。跨入新世紀以來，萬壽寺成為卓尼轄區內規模和建築在甘南藏區僅次於拉卜楞寺的第二大藏傳佛教寺院，但其各方面均不及往昔，現有僧人四百八十七人。
文物
萬壽寺內供奉著眾多的三所依止聖物。有印度請來的鎦金釋尊像；自然生成的宗喀巴像；大理石釋尊像、白度母象、蓮花生大師語化天成像；五世達賴喇嘛金像，東印度塑造的釋迦銅像；宗喀巴自塑像；宗喀巴語化像，商賈格勒理像，紅石度母天成像。有三千餘幅各類捲軸的唐嘎和數不清的一肘以下佛像；有貝葉經《八千頌》，多部《甘珠爾》、《丹珠爾》。有歷世達賴喇嘛、班禪、嘉木樣及拉考倉等大師的文集；有銅製鎦金釋迦牟尼冠冕；迦葉佛的祖衣；那若巴大師的骨飾；神喇嘛菩提光的肉舍利，宗喀巴大師的佛牙；達哇桑吾的靈蓋骨、乃穹寺的法號及佛舍利等。有歷世達擦活佛、歷世第穆活佛、歷世熱振活佛、歷世察道活佛以及赤欽·阿旺諾吾、赤欽·青熱旺秀等的僧衣。
萬壽寺原建有大經堂，聞思學院，時輪學院、密宗學院、醫藥學院、印經學院和法舞學院等。有內千佛外千佛的釋尊殿、度母殿、大悲觀音殿、無量壽佛殿、持金剛大輪佛殿、大塔殿、護法殿、有五所藏經室以及德陽佛堂和喇嘛噶繞，貢瑪倉、嘉龍哇倉、熱旦加措、肖吾倉、尼日倉、噶根倉等七位活佛的納欽及具嘉吉祥的佛塔。總計經堂和佛殿達二十四座，這些經堂和佛殿上安置有金頂、寶頂、祥麟法輪、寶瓶、檉柳女牆等，莊嚴魏觀，金碧輝煌，一見頓生敬仰。鼎盛時期僧人達七百多人，有三百八十多餘院僧舍。一九五七年三月，應車巴溝僧俗之邀請已圓寂的第六世貢唐大師久美·丹貝旺旭在這座寺里舉行了第五次時輪大灌頂。一九五八年叛亂前，這座寺院成為甘南地區規模僅次於拉卜楞寺的大寺院。但一九五八年反封建鬥爭和一九六九年以後的十年"文革"中毀壞殆盡。
宗教活動
萬壽寺每年的經會和法事有：正月神變節祈願法會時，舉行曬佛、跳密宗舞、酥油花供仰、迎彌勒佛轉寺；二月舉行春季大法會；三月舉行時輪法舞法會；四月舉行每日法會、續部彩粉壇城及自入儀軌；五月舉行嘛呢供修丹丸節；六月進行夏令安居；七月舉行“柔扎”法會並跳法舞；八月進行考試；九月舉行秋季法會；十月舉行冬季法會，十一月舉行驅魔施食儀軌。此外，還有多次如期舉行的上師園寂紀念日祭祀法會。
扎喜欽庫林四大扎倉的念誦腔調、制度、行為規範與拉卜楞寺相同。寺院法台也由拉卜楞寺派遣和委任。
名稱
扎西欽庫林是貢巴寺的藏文名稱，其漢文之名應是“萬壽寺”。但在漢文的書寫過程中將藏語的寺院之名“貢巴”與漢語的“貢巴”之名寺院合寫形成了沒有多大意思的“貢巴寺”之名稱，並且一錯再錯書寫於當今的行文之中，其實這是一種錯誤的書寫，我們應該糾正過來，把他稱“萬壽寺”，還其本來的面貌。稱“萬壽寺”是有歷史根據的，是光緒皇帝御賜的，是皇太后六十大壽的祝壽寺，所在在萬壽的修建過程中大清國上至將相大臣，下至地方文武官員和虔誠的信徒，都進行了捐資，使得在短短的幾年間，四大學院修建竣工，而且金碧輝煌，沒有大清國的支持，車巴溝本身的力量是力不從心的，所以萬壽寺的修建顯示了大清國的皇恩浩蕩和以教治國的方略，也是對西北地區的重視和對貢噶堅贊的關護，這不僅是歷史，而且符合史料中記載的“一座喇嘛廟勝抵十萬兵”的事實。
