培訓階段
按衛生部近年頒布的《臨床住院醫師規範化培訓試行辦法》，培訓分二個階段。2009年發布的《住院醫師規範化培訓標準（試行）》明確說明規範化培訓時間一般為3年。
第一階段
三年，在二級學科範圍內，輪轉參加本學科各主要科室的臨床醫療工作，進行全面系統的臨床工作基本訓練。
第二階段
兩年，進一步完成輪轉，逐步以三級學科為主進行專業訓練，深入學習和掌握本專業的臨床技能和理論知識，最後一年應安排一定時間擔任總住院或相應的醫院管理工作。
基本做法
1.以臨床實踐、專業必修課、公共必修課專業課為培訓的主要內容，要求住院醫師在二個階段分別通過考試取得相應課程學分。
2．培訓的方法：臨床實踐以在崗培訓為主，由科室集體指導。外語及專業必修課主要通過自學完成，部分公共必修課和選修課則通過業餘辦班面授完成，也可通過自學、參加該課水平測試獲得學分。
3.對工作滿5年，學分符合要求者，經臨床能力考核合格，發給住院醫師培訓合格證書，作為申報中級專業技術職務任職資格的必備條件。為部分在職臨床醫師申請臨床醫學專業學位所需，對從事臨床工作3年以上，完成住院醫師第一階段規範培訓並通過考核者，可發給《住院醫師規範化培訓合格證書》。
在實施住院醫師規範化培訓中，應根據“知識寬、基本厚”的要求，注重醫德培養，強調三基訓練，先寬後專，循序漸進，加強臨床實踐，以理論聯繫實際為原則。制度中注意：①培訓——考核——晉升相結合，以利於調動培訓的積極性；②實行以實踐為主、技能為主，自學為主，業餘為主的在崗培訓，以利於改變輕實踐的傾向；③知識結構力求合理，注重醫療、醫學科研相結合，以打好紮實的基礎。
考核評估
住院醫師培訓的考核必須規範，並逐漸達到標準化的要求。考核分平時考評和階段考試、各醫院自行組織考核和省、市高等學校統一組織的理論考試、計算機考試等不同方式，其考核內容和程式如圖3所示。
科室考評
每一科室輪轉結束，由科主任組織考評小組人員，以無記名投票方法對住院醫師的醫德醫風、臨床技能、教學能力作出綜合評價，記入輪轉手冊。醫德醫風的內容包括：①對工作的責任心、服務態度，遵紀守法、勞動紀律的評定；②醫療作風的評定；③有否差錯、事故；④團結互助、顧大局、識大體的表現。評為優或良者為合格，如醫德醫風不合格者，則該年該輪轉中臨床實踐均不記學分。對臨床技能如病史採集能力、全面體檢能力、操作及手術技能，採取面對面考核的辦法，並須達到規定的學分。
外文水平
選用英文版克氏外科學和希氏內科學內容。水平測試每年舉行一次，住院醫師進入第二階段起均可參加外文水平測試，形式為英譯中，要求達到2小時完成4000印刷符號的翻譯量。
專業理論
即將結束第二階段培訓的住院醫師必須參加統一組織的專業理論考試。以達到各專業低年資主治醫師的基本要求。
臨床能力
包括專業技術及臨床決策能力兩方面，前者由專家對住院醫師的病史採集、體檢能力、醫療操作技能、手術操作技能等進行面對面考核；而後者則分別在第一階段與第一階段培訓結束時進行。可採用面對面病例分析的考試方法，也可使用計算機輔助考試系統進行測試，使臨床決策能力測試向更加科學的方向發展。為了在培訓中加強和鞏固住院醫師的問診和體檢的臨床技能，還可引入標準化病人的考核方式。
原則
培訓遵循六方面的原則
住院醫師培訓正在從無到有走向逐漸規範的過程之中，開展此項培訓的醫院在管理中遵循六方面的原則，即：①堅持：“紅”、“專”結合的原則；②理論聯繫實踐並以實踐為主的原則；③堅持自學與輔導相結合併以自學為主的原則；④堅持工作與學習相結合，以工作為主的原則；⑤堅持“嚴謹作風、紮實基礎、寬廣知識”，注意能力培養的原則；⑥堅持培訓、考核，使用一體化原則。只有這樣才能真正培養出適合我國社會主義衛生工作需要的醫療實用性人才和醫學高級專家。
雲南省於06年7月，以昆明醫學院第二附屬醫院為試點醫院，就開始了3+2，共5年的住院醫師規範化培養。
從09年09月開始有天津為試點醫院，開始進行為期3年的規範化
2013年12月31日，國家衛生計生委等七部門聯合出台了《關於建立住院醫師規範化培訓制度的指導意見》，要求到2015年，各省（區、市）須全面啟動住院醫師規範化培訓工作；到2020年，基本建立住院醫師規範化培訓制度，所有新進醫療崗位的本科及以上學歷臨床醫師，全部接受住院醫師規範化培訓。
2014年2月13日，建立國家住院醫師規範化培訓制度工作會議在上海召開，這標誌著我國住院醫師規範化培訓制度建設正式啟動。
