蛋白水解(英語:Proteolysis)是指蛋白質降解為較小的多肽或胺基酸的過程。通常情況下,被水解的都是肽鍵,且在蛋白酶的作用下進行,因此常用蛋白酶解。但也可能發生分子內消化,以及不依賴酶的途徑,如酸和熱的作用而產生的降解。
蛋白酶解在有機體中有多種用途,比如消化酶降解食物中的蛋白,為機體提供胺基酸;完成翻譯的多肽鏈也需要水解加工才能產生有活性的蛋白質;某些生理和細胞過程的調控也是通過蛋白質的酶解進行;還有蛋白酶解可以防止不必要的或不正常的蛋白質在細胞中的積累。
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