學生會常務委員會下設以下12個部門和1個分會,即秘書處、體育部、文娛部、外聯部、宣傳部、學習部、新聞部、學生權益部、拓展平台、醫療實踐部、院報編輯部、青年志願者協會和榆中分會，各部門秉持“服務、協作、高效”原則，樹立“創新、紮實”的理念，發揮學生會“自我管理、自我教育、自我服務”的三自功能，高效完成學生會各項工作。
秘書處：主要負責院學生會的日常工作，如文檔、物品、財產的管理。它的另一個重要職能是協調和監督各部門的工作。此外還負責常委和各部之間的溝通工作。秘書長列席常委會。
外聯部：主要負責學生會的外聯工作。與各企事業單位做好溝通與交流，與之建立良好的合作關係，為學生會的活動提供資金支持，保障活動的順利開展，同時協助常委會做好與兄弟學院的交流與合作。
學習部：舉辦本院特色活動“解密人體”等，幫助同學們在輕鬆中學習，培養學習興趣，讓更多的同學了解人體奧秘。
宣傳部：負責學生會各項重大活動的宣傳工作，進行海報、橫幅、宣傳板的宣傳。
學生權益部：負責定期進行宿舍衛生檢查，監督和保證學生有一個良好的生活環境；通過調研，引導同學理性維權，並為各項活動做後勤保障。
體育部：負責組織院內各項學生體育活動，提高全院同學們的身體素質，激發一種人人參與的風氣，培養團結協作的精神、增強班級凝聚力。
文娛部：以豐富校園文化生活，活躍校園活動分為為主。承辦本院迎新晚會以及紀念五一二國際護士節晚會等大型文娛活動，以推進校園精神文明建設。
新聞部：負責院內新聞的收發整理，在校內樹立基礎醫學院學生會形象，打造學生會良好品牌，宣傳學生會活動，同時秉承學生會一貫的“為同學服務”的宗旨，全心全意去服務同學。
拓展平台：拓展平台負責本院學生會與素質拓展有關的活動，例如定期的學生幹部培訓，素質拓展訓練，解密人體活動等。
醫療實踐部：“學以致用，醫者仁心”，作為基礎醫學院學生會，將所學知識與實踐結合起來顯得尤為重要，醫療實踐部主要負責解密人體活動等，讓全校學生能夠更深入的了解醫學知識。
院報編輯部：負責本院的院報編輯工作，同時協助其他部門進行活動的安排和進行。
青年志願者協會：是由我院志願從事社會公益事業與社會保障事業的同學所組成的非營利性社會組織，其宗旨是奉獻、友愛、互助、進步。通過組織和協調我校志願服務活動，為有特殊困難以及需要幫助的社會成員提供志願服務。
榆中分會：為適應醫學本科生1+4培養模式要求，基礎醫學院學生會建立榆中分會，負責本院學生會榆中校區的相關工作。
