基因組
蘋果基因組草圖是科學家繪製的“金冠蘋果”的基因組草圖。研究人員表示，也許是大量的重複基因使蘋果具有較多的染色體數目。與蘋果同屬薔薇科的桃和草莓等水果的染色體數在7到9之間，而蘋果的染色體數為17。
揭露蘋果的身世
科學家認為，當年地球遭遇巨型隕石襲擊時，大量灰塵被推入大氣層中，遮蔽了陽光，降低了植物的光合作用，進而對全球各地的生態系統造成毀滅性的影響，令地球上的大部分生物包括恐龍滅絕，而蘋果的祖先卻死裡逃生，通過進化獲得了新生。科學家對蘋果的基因組進行分析後發現，該事件讓蘋果樹的祖先發生了巨大的基因突變，它某些染色體中的大部分基因（這些基因與水果的發育有關）不斷自我複製擴張至其他染色體中，這些額外增多的基因，讓它可以在更為嚴苛的環境下生長，並結出更大、更結實、更鮮美多汁的果實，同時也令它最終成長為一棵樹，而非維持在灌木狀態，從而促成了蘋果樹和蘋果的出現。
研究人員也指出，蘋果發生變異的時期，白楊樹等植物也出現了基因變異，這表明，一些重大的環境事件令一些物種包括蘋果通過進化獲得了新生。
研究同時還發現，最古老的蘋果品種“新疆野蘋果”並非生長在“伊甸園”，而是生長在南哈薩克斯坦山脈
