根據病人的基因型進行藥物處方會增加個人處方的費用，但通過避免藥物副作用卻有望降低整體醫療保健的費用。
能否意識到藥理遺傳醫學將會帶來的好處部分取決於公眾和醫療保健體系能否接受遺傳檢測使用率的大幅增長。開藥前進行這樣的遺傳檢測將會變成十分平常的事情。
然而，挑戰來自醫療保健競技場上的每一名運動員，Robertson和他的合著者說。醫生們將必需習慣於使用遺傳檢測手段，通過檢測結果來做出臨床處置決定。保險公司將不得不接受和承認基因型檢測和藥理遺傳學的價值。病人將不得不得到保證，遺傳檢測的價值超過它可能帶來的潛在風險：自己遺傳信息的不甚泄露。
Robertson 寫道，人們將不得不以看待血液檢測檢查膽固醇水平的眼光來看待DNA檢測。
隨著越來越多的預測性遺傳檢測納入軌道，對美國食品與藥物管理局（the US Food and Drug Administration ，FDA)加大監管力度，確保檢測的合法性、有效性和正確標記的要求也會越來越高。
儘管藥理遺傳學革命給人的最初印象是革命會使醫藥公司受益，但文章作者認為，醫藥業面臨的現實情況可能更為複雜。“從長遠來看，一個發展良好的藥理遺傳醫學將會破壞當前醫藥公司將研發重點放在能夠獲得專利、帶來巨大財源的重頭藥物的規律。”他寫道。
Robertson 補充說，另一方面，藥理遺傳學的發展也為製藥業提供了使藥物通過FDA許可的機會，否則這些藥物就會因引起某些病人產生副作用而無法通過FDA許可。
一個很好的例子就是Lotronex藥(鹽酸阿洛塞得龍,alosetron hydrochloride，美葛蘭素威爾康公司產品)。FDA對該藥的使用標籤增加了安全告示。Alosetron是一種5-羥色胺拮抗劑，用於治療以腹瀉為主的婦女腸易激綜合徵。新的標籤突出了關於該藥潛在的嚴重便秘併發症和缺血性結腸炎危險的資料，並指明該藥只適用於至少三個月內不歸因於器官病變引起的綜合征婦女。
修改後的標籤申明，該藥處於便秘期婦女不應使用，並有下列禁忌症：慢性或嚴重便秘，或便秘後繼症；腸梗阻史，或狹窄、毒性巨結腸、胃腸道穿孔、和/或粘連；缺血性結腸炎史；活動性憩室炎；現（或既往）克羅恩氏病或潰瘍性結腸炎。FDA並且要求，該藥銷售時附帶用藥指導（新核准標籤）以幫助病人把握其潛在危險，及時採取措施以防嚴重後果。隨即，美葛蘭素威爾康公司在有報導證明該藥存在嚴重副作用後，於200年11月自動從美國市場上收回了該藥。
“ 如果該藥的副作用與某一代謝基因的突變有關，這一點無論對於病人還是對於醫藥公司都極為重要。”Robertson 表示。
