目的
藥價虛高制定“藥品零差價”政策的直接目標是為了減少藥品銷售過程中過多的中間流通環節，最終使虛高的藥價降下來，但藥價高的根源並不在此，流通環節過多只是其中的原因之一。最根本的還是盈利與非盈利性醫院功能定位不明確，配套措施不到位。由於政府投入不到位，占醫院總數近90%的非贏利性醫院不得不“以藥養醫。”
在2008年10月份公布的《關於深化醫藥衛生體制改革的意見（徵求意見稿）》中對基層醫療衛生機構提出了“藥品收支兩條線和零差率銷售”的管理辦法，希望為解決老百姓“看病貴，看病難”的問題探索出一條新路，但是否行之有效呢？
弊端分析
一. 當衛生院被納入政府集中招標採購體制並被要求零加價賣藥後，為激勵衛生院採購中標藥品，返點和回扣就成為藥企必需的行銷手段了。按照以前的實際批發價，藥企是沒有足夠的利潤空間進行返點和回扣的。其次，零差價制度是一種更為嚴格的加價率管制政策，它和15%的加價率管制政策存在同樣的弊端，即藥價越高越受醫療機構青睞。在此制度下，衛生院不能合法加價賺錢，但是它卻完全有能力通過索要返點和回扣的方式私下謀利。
二 . 由於絕大多數基本藥物同一品種中標企業有多家，衛生院擁有選擇權，從而擁有索要返點和回扣的能力，競標藥企也很清楚這一點，所以在投標價格中必須預留返點和回扣空間。這一藥品投標和購銷模式不過是此前公立醫院藥品購銷模式和政府集中招標採購模式的簡單複製，藥企輕車熟路，衛生院也早已耳濡目染，雙方完全是心有靈犀、一拍即合。因此，實施零差價制度後，到底採購哪家藥企的藥品，衛生院的主要考量因素是返點和回扣的高低，藥品質量基本不在衛生院考慮之內，因為政府集中招標已經遴選過質量。換句話說，只要選購的是中標藥品，即使出現質量問題承擔責任的也應該是招標機構而不是衛生院，況且衛生院及其醫生也沒有能力判斷藥品質量，尤其是此前沒有使用過的基本藥物。
三。由於醫院醫生和鄉村醫生在零差價管理後會出現很大的利益受損，醫院醫生出現醫生沒有回扣和灰色收入，但是院長以及一些採購藥物領導可以拿到更多的回扣返點。可能會出現醫生工作積極性不高，以及大批的公立醫生跳槽到私立醫院和自立門戶開私人診所。特別是鄉村醫生也會有大批改行跳槽，或者搞一些非法渠道的藥品。因為國家補貼的收入遠遠不如自己私營時候的收入，還要做更多的健康檔案材料。
問題
第一
品種不齊全。列入零差價率範圍的藥品有300多種，基本上是都是常見病、多發病用藥，難以滿足患者的用藥需求；
第二
供應得不到保障。由於利潤低，配送成本高，商業企業配送的積極性不高，生產零差價率的藥品基本上是微利，並且數量難以大幅增加，生產企業積極性也不高，造成了列入零差價的藥品經常缺貨；
第三
醫院用量不大。對於價格低，補貼少的零差價藥來說，基層醫院用藥的意願也並不強烈；
第四
對零售藥店造成了衝擊。社區醫院藥品銷售零差價政策實行，不可避免地分流了一部分原本是零售藥店的客戶，也引起了藥店從業人員的憂慮。
從整條醫藥產業鏈來看，生產企業、商業企業、醫院、藥店似乎都不滿意藥品零差價政策，而最重要的是，患者也沒有明顯感受到政策帶來的好處。
醫院體制改革是整個醫改的關鍵，解決“以藥養醫”問題是核心。如果不解決這一根本問題，僅通過政府的強制手段來推行“藥品零差價”，可能很難持續下去，因為這違背了客觀的市場規律。我國30年的改革實踐也證明，以“計畫”代替“市場”來調節資源配置，往往適得其反。
建議
第一
應該首先明確界定贏利與非贏利醫院的功能定位，降低非贏利性醫院的比例，增加公立醫院投入，而醫院除了保證急診與住院患者的用藥需求外，不再銷售藥品，門診患者憑醫生處方到藥店買藥，全國有34萬家藥店，通過政府引導下的市場競爭，應該能夠有助於降低虛高的藥價。如此，藥品的生產、流通和使用環節都將隨之理順，一個健康有序的醫藥市場指日可待 。
第二
“社區首診、雙向轉診和康復回社區”的方向不應改變，不過由於社區醫院目前的就醫條件不是很好，除了硬體設施比較差，優秀的醫生也比較少，人們尚未形成進社區看病的習慣。建立建全全科醫師培養機制，為社區醫療機構輸送優秀人才，提高社區的醫療服務水平，引導廣大患者到社區就醫看病，可以有效地減少醫療成本。為解決“看病貴，看病難”多提供一個方向。
前景
藥品零差價由於納入社區醫院藥品零差價管理的藥品品種有限，所以從短期來看，部分城市的社區醫院藥品零差價的試點應該不會對當地的零售藥店產生巨大的衝擊。但是兩三年之後，隨著社區醫院藥品零差價的政策在全國範圍內全面展開，在政府的大力支持下，基層社區醫院的軟硬體會不斷完善，肯定會吸引更多的患者在社區就醫，所以從長期來看，一定會對藥店的零售業務帶來很大的衝擊，零售藥店不得不未雨綢繆。
藥店有品種豐富的優勢，有交通便利的優勢，還有成熟的採購網路，藥品的採購價一般也比社區醫院低，不足之處在於其服務能力比較弱。這一方面可以通過提高從業人員的素質來提升服務水平，另外一條可行之路是同社區醫院合作，實現優勢互補。
通過研究分析社區醫院的用藥特徵，藥店也可以與社區醫院展開錯位競爭，為周邊患者提供社區醫院所沒有而患者又需要的服務和產品。對於部分有實力的藥店，也可以向藥妝、個人護理、健康管理等方向發展，通過業務單元的多元化來增強抵禦風險的能力。
