人物生平
藤原不比等畫像669年（天智天皇八年），藤原不比等11歲時，父親藤原鐮足去世。雖然藤原鐮足生前的政治立場傾向於近江朝，但壬申之亂之時，藤原不比等才只有13歲，與交戰的兩方都沒有關係。在戰後，藤原不比等既沒有作為近江朝的一方受到處罰，也沒有作為天武朝的一方受到獎勵。但是，以中臣金為首的藤原鐮足的同族（中臣氏）中的實力派都作為近江朝廷的要人，受到了處罰，在天武朝的時代，中臣（藤原）氏被從朝廷中樞掃了出去。沒有強力後台的藤原不比等只能從下級官僚做起。到了持統朝，藤原不比等任直廣肆（從五位下）判事。
因為藤原不比等在697年（文武天皇元年）有擁立草壁皇子之子輕皇子（文武天皇）即位之功，並作為文武天皇的保護人而登上了政治的前台。由於縣犬養三千代的丈夫美努王前往九州擔任太宰師，讓縣犬養三千代獨守空閨，得以相近長期把持天皇的寵臣藤原不比等。藤原不比等的正室也過世，因此二人有了親密發展，並進而共同謀策政治行動。而且藤原不比等在後宮的縣犬養三千代（文武天皇的乳母）的幫助下，加深了和皇室的關係，將女兒藤原宮子嫁給了文武天皇。之後藤原不比等與縣犬養三千代生的女兒藤原光明子又進一步嫁給了聖武天皇。另外藤原不比等在尚未與橘三千代往來前即有四個兒子，也都因縣犬養三千代的關係及影響力而能擔任朝廷高官。雖然縣犬養三千代生前深獲持統天皇、文武天皇、元明天皇等三朝天皇之寵，然而最重要的還是她通過與藤原不比等所生的女兒藤原光明子將自己的血統流入了皇室。藤原光明子在藤原不比等死後，藉助藤原不比等的兒子們藤原四兄弟之力，成為光明皇后，開了日本歷史上人臣皇后的先例（以前的皇后，必須出身皇族）。
700年（文武天皇四年）藤原不比等參與撰修《大寶律令》。701年（大寶元年），藤原宮子生下首皇子（聖武天皇）。藤原不比等由中納言升為正三位大納言。同年，藤原不比等的外孫首皇子（聖武天皇）誕生。704年（慶雲元年），藤原不比等的官位升為從二位，增封八百戶。705年（慶雲二年），藤原不比等患病，受賜度者二十人，布四百端，米八十石，在京師的各寺祈禱病癒。707年（慶雲四年），文武天皇下詔：“藤原不比等勤勞奉公，並追褒藤原鐮足，乃賜封五千戶，傳子孫。”藤原不比等固辭，最終受二千戶，將一千戶傳給子孫。708年（和銅元年），藤原不比等升為正二位右大臣。
711年（和銅三年），遷都平城京之際，藤原不比等把藤原氏的家寺由山階寺轉移到奈良的興福寺。
718年（養老二年）藤原不比等被推為太政大臣，固辭未就，盡力於律令政治的實施。之後，當藤原不比等正要進行養老律令的編纂之時，於720年（養老四年）病篤，養老律令的編纂暫時中止。元正天皇下賜藤原不比等度者三十人，並下詔：“右大臣藤原不比等病篤，朕寢食不安，希望他康復，卻無有效的方法。此時應大赦天下，今日午時以前，無論罪行輕重，都加以赦免。殘廢之人，生活不能自理者，根據情況加以撫恤。所在地的地方長官，要親自慰問，根據情況提供醫藥。”之後，元正天皇又下令京師四十八寺一齊誦讀《藥師經》，免官戶十人為良民、奴婢十人為官戶。但是，過了幾天，藤原不比等仍然去世了，享年62歲。
死後殊榮
元正天皇對藤原不比等的去世深感哀悼、痛惜，到了荒廢朝議的程度。元正天皇派遣大納言長屋王、中納言大伴旅人，到藤原府宣讀詔書：“追贈藤原不比等為正一位太政大臣，贈諡文忠公。”
在藤原不比等去世之前，藤原氏並沒有設定氏長者（氏長者相當於族長，有一定的權威）。從藤原不比等起，開始設立藤原氏的氏長者（即藤氏長者）。
天平年間，聖武天皇將渤海國的貢物的一部分祭祀藤原不比等之墓。天平寶字初期，孝謙天皇敕令天下，不得取名為“鐮足”、“不比等”。760年（天平寶字四年），孝謙天皇下詔：“子以祖尊，祖以子貴。先朝太政大臣藤原不比等，功高於天下，又為皇家之外戚，所以先朝追贈其為正一位太政大臣。雖然正一位太政大臣已經官至極品，但於周禮仍有不足。藤原不比等的功績蓋於宇宙，應該依照齊國姜太公的例子，追封近江國十二郡，為淡海公。繼室從一位縣犬養三千代賜正一位太夫人。”
生世之謎
如概述中所述，《公卿補任》等認為藤原不比等實際上並不是藤原鐮足之子，而是天智天皇的私生子。《公卿補任》關於藤原不比等的部分，記載有“有傳言說實際上是天智天皇的皇子，內大臣大職冠鐮足的次子一名史，母親是車持國子君之女、與志古娘也、車持夫人”。《大鏡》中記載了天智天皇在懷孕的女御發還給中臣鐮足之際，說：“生下的孩子如果是男孩，就給他作兒子，如果是女孩，就是朕的。”當男孩出生後，即是藤原不比等的出生。《尊卑分脈》等有同樣的記載。到了平安時代，這個傳說被認為有相當的可信性，《竹取物語》中，向輝夜姬求婚的5個貴公子中，有一個車持皇子的原型就是藤原不比等。車持皇子的名字意味著母親是車持氏出身的皇子。在歷史學者之間，認為藤原不比等是皇子的很少。但如果藤原不比等是皇子的話，其後藤原不比等出人頭地的特例也就說得通了，可以作為天武天皇、持統天皇兩朝皇親政治（由天智、天武系皇子就任朝廷的要職，掌管政治中樞的政治形態）的延伸，也有從這個角度出發，認同藤原不比等是皇子的學者。
家族成員
父：藤原鐮足
母：車持與志古娘（車持國子之女）
兄：僧定惠（又名定慧，俗名是中臣真人）
妻：蘇我娼子（又名媼子，蘇我連子之女）
妻：中臣五百重娘（藤原不比等的異母妹，原來是天武天皇夫人）
妻：賀茂比賣（賀茂小黑麻呂之女）
妻：縣犬養三千代（即橘三千代，縣犬養東人之女）
長男：藤原武智麻呂（680-737，蘇我娼子之子，藤原南家之祖）
次男：藤原房前（681-737，蘇我娼子之子，藤原北家之祖）
三男：藤原宇合（694-737，蘇我娼子之子，藤原式家之祖）
四男：藤原麻呂（695-737，中臣五百重娘之子，藤原京家之祖）
長女：藤原宮子（683?-754，文武天皇夫人、聖武天皇之母，賀茂比賣之女）
次女：藤原長娥子（長屋王之妃，賀茂比賣之女）
三女：藤原光明子（701-760）（又名安宿媛、藤三娘，聖武天皇之皇后，孝謙天皇之母，縣犬養三千代之女）
四女：藤原多比能（橘諸兄之妻，生母不明）
