個人經歷
蕭啟慶1959年台灣大學歷史系畢業。1963年台灣大學歷史研究所碩士。1965年美國哈佛大學遠東區域研究碩士。1969年哈佛大學遠東語言與文明系博士 。1969-1974年任美國明尼蘇達州立聖雲大學助教授。1971-1972年任台灣大學歷史系客座副教授。1974-1985年任新加坡國立大學歷史系高級講師，1986-1994年任歷史系教授。1994年起任台灣清華大學歷史研究所教授。2000年當選台灣中研院院士。
學術研究
"The Military Establishment of the Yuan Dynasty" (PhD diss., HarvardUniversity).
專書
《西域人與元初政治》（國立台灣大學文史叢刊19；台北：國立台灣大學文學院，1966）。
《元代史新探》（台北市：新文豐出版公司，1983）。
《蒙元史新硏》（台北：允晨文化事業司，1994）。
《元朝史新論》（台北：允晨文化事業公司，1999）。
蕭啟慶主編，《蒙元的歷史與文化：蒙元史學術硏討會論文集》（台北：台灣學生書局，2001）。
《內北國而外中國：蒙元史硏究》（北京：中華書局，2007）。
《元代的族群文化與科舉》（台北：聯經出版事業公司，2008）。
論文
〈元色目文人金哈剌及其《南遊寓興詩集》〉，《漢學研究》13.2 (1995)：1-14。
〈中華福地、古月還家：蒙元興亡與讖緯〉，《歷史月刊》92 (1995.9)：54-60。
〈內北國而外中國：元朝的族群政策與族群關係〉，《歷史月刊》94 (1995)：51-58。後收入歷史月刊社編，《族群融合三千年》（台北：歷史智庫出版公司，1996），頁121-136。
〈元朝的通事與譯史──多元民族國家中的溝通人物〉，《慶祝札奇斯欽教授八十壽辰學術論文集》（台北：國學文獻館，1995），頁199-267。
〈宋元之際的遺民與貳臣〉，《歷史月刊》99 (1996.4)：56-64。後轉載於紐約《世界日報》，1996.07.08。
〈陳垣傳〉，收入國史館編，《國史擬傳》（台北：國史館，1996），第6輯，頁121-136。
〈元代各族士人間的文化互動：書緣〉，《勞貞一先生九秩慶論文集》（台北：蘭台出版社，1997），頁1-29。
〈元明之際的蒙古色目遺民〉，《慶祝鄧廣銘教授九十華誕論文集》（石家莊：河北教育出版社，1997），頁103-121。
〈元朝多族士人的雅集〉，《香港中文大學中國文化研究所學報》新6 (1998)：197-203。
〈元代科舉與江南士大夫之延續〉，《元史論叢》7 (1999)：1-19。
〈元代多族士人圈的形成〉（演講稿），《中央研究院學術諮訊總會通訊》8.2 (1999.10)：66-73。
〈元延祐二年與五年進士輯錄〉，《台大歷史學報》24 (2000.1)。
〈元代蒙古色目進士背景的分析〉，《漢學研究》18.1 (2000.6)：101-128。
〈元至順元年進士輯錄〉，《國立台灣大學文史哲學報》52 (2000.6)：175-177, 179-204。
〈陳垣傳〉，《國史館館刊》29 (2000.12)：159-173。
〈元季色目士人的社會網路：以偰百遼遜青年時代為中心〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》74.1 (2003.3)：65-96。
〈元明之際士人的多元政治抉擇──以各族進士為中心〉，《台大歷史學報》32 (2003.12)：77-138。
〈九州之外有斯人：元代多族士人的群體意識〉，《清華學報》35.1 (2005.6)：1-35。
〈推陳出新的史學家陳垣〉，《新史學》16.3 (2005.9)：101-136。
〈元朝科次不詳進士輯錄〉，《簡牘學報》19 (2006)：283-368。
〈中國近世前期南北發展的歧異與統合──以南宋金元時期的經濟社會文化為中心〉，《台灣師大歷史學報》36 (2006.12)：1-29。
〈中國近世前期南北發展的歧異與統合：以南宋金元時期的經濟社會文化為中心〉，收入清華大學歷史系、三聯書店編輯部合編，《清華歷史講堂初編》（北京：生活‧讀書‧新知三聯書店，2007），頁198-222。
會議論文
〈元朝的統一與統合──以漢地江南為中心〉，《中國歷史上分與合學術研討會論文集》（台北：聯經文化出版公司，1994），頁191-212。
〈近四十年台灣元史研究的回顧〉，收入新嘉坡大學中文糸編，《漢學研究之回顧與前瞻會議論文集》（北京：中華書局，1995），頁96-104。後轉載於《蒙古學信息》1996.2：19-25。
〈元朝多族文士圈的形成初探〉，《第二屆宋史學術探討會論文集》（台北：中國文化大學，1986），頁165-190。
〈蒙元統治對中國歷史發展影響的省思〉，《第二屆中國邊疆史討論會論文集》（台北：蒙藏委員會及台灣師範大學歷史糸，1996），頁1-16。
〈元代科舉與江南士大夫的延續〉，發表於「元史及宋元文化」國際討論會，廣州，1997年5月19-23日。
〈蒙元時代高昌偰氏之仕宧與漢化〉，收入中央研究院歷史語言研究所編，《中國近世家族與社會學術討論會論文集》（台北：中央研究院歷史語言研究所，1998），頁263-299。
〈五年來海峽兩岸元史研究的回顧〉，《中華民國史專題第四屆討論會論文集：民國以來的史料與史學》（台北：國史館，1998），頁755-784。
〈凱撒的還給凱撒：從傳記論中究外成吉思汗研究〉，《成吉思汗學術討論會論文集》（台北：蒙藏委員會，1998），頁1-24。
〈元代蒙古色目士人層的形成與發展〉，發表於慶祝北京大學成立一百周年「國際漢學研究會議」，北京，1998年5月5-8日。
〈元朝南人進士分布與近世人才區域升沉〉，發表於「海峽兩岸蒙元史」學術研討會，台北，1999年5月7-9日。
〈蒙元支配對中國歷史文化的影響〉，發表於韓國「第19次中國學國際學術大會」，漢城成均館大學，1999年8月20-21日。
〈元朝蒙古色目進士背景的分析〉，發表於韓國大邱慶北大學，1999年8月24日。
〈元朝的區域軍事分權與政軍合一〉，發表於國史館主辦，「中國歷史上的中央與地方」學術討論會，1999年12月15-17日。
〈元至治元年進士輯錄〉，《宋旭軒教授八十榮壽論文集》（台北：宋旭軒論文集編委會，2000）。
