學術專門領域
先秦儒學
宋明理學
中國哲學史
思想概述
對先秦儒家哲學知析論：主要是對孔子、孟子、荀子三家哲學之基本綱領義理，做統括性的疏導說明。
對宋明理學之講述：則分南、北宋到明代陽明學，體系性地加以講述。
大體系延續 牟宗三《心體與性體》之脈絡，再加闡述辨析。
對中國哲學史之闡論：對於中國哲學之源流、特質、學術史之分期、研究方法、哲學思想之介紹、闡述、系統分判、發展路向均有論列。
對儒家學術與中國現代化之提倡：闡述儒家“民本、民貴”思想、“開物成務”、“格物致知”與現代民主、科學思想之連續性與貫通性。
專書著作
六七十年代
《家國時代與歷史文化》，1960，香港，人生
《孔門弟子志行考述》，1967，台北，商務
《儒家哲學與文化真理》，1971，香港，人生
《王陽明哲學》，1974，台北，三民 1996，韓譯版印行，譯者黃甲淵
《宋明理學．北宋篇》，1977，台北，學生
《墨家哲學》，1978，台北，東大
八十年代
《宋明理學．南宋篇》，1980，台北，學生
《新儒家的精神方向》，1982，台北，學生
《孔孟荀哲學》，1984，台北，學生 1998，韓譯版印行，譯者千炳敦
《儒家思想的現代意義》，1987，台北，文津
《熊十力先生學行年表》，1987，台北，明文
《中國哲學史大綱》，1988，台北，學生
九十年代
《儒家心性之學論要》，1990，台北，文津
《儒家的常與變》，1990，台北，東大
《中國哲學的反省與新生》，1994，台北，正中
《牟宗三先生學思年譜》，1996，台北，學生
《論語人物論》，1996，台北，商務
《孔子的生命境界》，1998，台北，學生
《牟宗三－中國歷代思想家叢刊》，1999，台北，商務
《蔡仁厚教授七十壽慶集》，1999，台北，學生
2000年後
《哲學史與儒學評論》，2001，台北，學生
《新儒家與新世紀》，2005，台北，學生
《王學流衍：江右王門思想研究》，2006，北京，人民
《中國哲學史》 (上下冊)，2009，台北，學生
