1978年從阿克蘇地區考進新疆大學物理系,曾任新疆大學學生會副主席、新疆大學團委常委、自治區學聯主席、自治區青聯副主席,直至全國學聯副主席。於1985年被第一批公派到日本大阪電器大學留學,1988年又前往美國加利福尼亞大學深造,並於1994年11月獲該校電器學博士學位。
旋即定居美國,並於1994年12月加入了“東突青年民主聯盟”美國分部,1996年直接策劃並參與了在美國的“東突民族解放中心”的成立活動,並擔任該組織執行委員,隨後當選為第一屆“世界維吾爾青年代表大會”教科文部部長。該組織是“世界維吾爾代表大會”(簡稱“世維會”)的前身之一,在2003年底被中國公安部認定為“東突”恐怖組織。 艾爾肯在日、美留學期間,就已經成為熱比婭集團的骨幹成員之一。他主張境外“東突組織”走“聯合之路”,並服從“美國維吾爾聯盟”的統一領導,共同開展分裂活動。
七五事件前,艾爾肯·斯蒂克潛回新疆,曾兩次到新疆大學,三次到新疆師範大學進行演講,打著學術交流和創業指導的幌子,演講內容大都是針對敏感問題的煽動性語言。最後潛入到新疆醫藥大學時,被監控錄像發現後遭到驅逐出境。