如果在幼蟲身體凸出部分覆蓋著腹纖毛輪,所形成的運動器官更具效率,並使幼蟲更具獨特形態。如彌勒幼蟲和格特氏幼蟲的纖毛葉,帽狀幼蟲的側葉,面盤幼蟲的面盤,輻輪幼蟲的觸手以及海膽支架幼蟲和柱頭蟲旋輪幼蟲的腕都是其中例子。有的幼蟲甚至以特殊形態的運動器官而得名。
除纖毛器官外,剛毛和特化的附肢也是多種水生幼蟲的運動器官。前者見於多毛類的游毛幼蟲,後者見於甲殼類幼蟲。沙蠶的游毛幼蟲(亦稱疣足幼蟲)以疣足上的剛毛作為遊動器官。有的游毛幼蟲在生出3個幼蟲體節(或稱生毛節)後即進行變態,但有的在生出多個體節之後仍保存著許多幼蟲器官,這時剛毛仍對幼蟲起作用。
甲殼動物的各對附肢(游泳足除外)在發生過程中普遍地都曾被用做運動器官。如無節幼蟲的大顎,溞狀幼蟲的觸角、顎足和胸足,糠蝦幼蟲的胸足以及金星幼蟲和葉狀幼蟲的胸足莫不如此。
以足作為運動器官的情形還可見於瓣鰓類的面盤幼蟲和昆蟲中的蠋形幼蟲。而且面盤幼蟲的匍足只能夠貼在地面上爬行,而蠋形幼蟲卻可以用胸足和腹原足快速行動。
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