腐殖質化階段
第一階段是在微生物作用下轉化為腐殖質的基本組成成分(結構單元)，如芳香族化合物(多元酚)、含氮化合物(胺基酸或肽)和糖類物質。
第二階段是各組成成分，主要是芳香族化合物(多元酚)和含氮的蛋白質類物質，縮合成腐殖質分子的過程。在這個過程中，微生物起著重要的作用，微生物分泌的酶(酚氧化酶)將多元酚氧化成醌，醌再與含氮化合物縮合形成腐殖質的單體分子。
（1）多元酚氧化為醌
氧化（2）醌和胺基酸或肽縮合
縮合腐殖質物質的分組及各組特性
腐殖質物質是土壤中自然形成的一類特殊高分子化合物，和土壤礦物質密切結合在一起。在對其進行研究時，把它們從土壤中分離出來。習慣上按照它們的顏色及在不同溶劑里的溶解度，將它們分為不同的組別。一般採用的分組方法如下：
腐殖質化過程土壤先後經過用鹼和酸處理後，分離出來的物質有三組，即胡敏酸、富里酸和胡敏素。這三組物質各有其獨特的性質。
（1）胡敏酸通常用H來表示。它是一類縮合程度不同的高分子化合物，黑色，在其分子組成中已經確定有兩種主要的結構單元：一種是酚型或醌型的芳香族化合物，另一種是含氮化合物。此外還可能有第三
種成分，即碳水化合物。
（2）富里酸常以F來表示。它是另一類高分子化合物，包含克連酸和阿波克連酸，前者無色或淡黃色，後者棕色。富里酸的分子結構與胡敏酸大致相同，比較簡單，所含c、H、N均比胡敏酸少，而含O量及羧基和羥基量較多。富里酸易溶於水，所形成的各種鹽類也都是可溶性的。富里酸的酸性強，活動性和分散性對土壤礦物質有強烈的破壞作用。
（3） 胡敏素主要是與土壤礦物質牢固相結合的胡敏酸，也可能是經過乾燥或冰凍影響而變質了的胡敏酸。它不溶乾鹼液，是腐殖質物質中最不活潑的部分。
以上所述的三組腐殖質物質，在各種土壤中均有存在，只是由於不同土壤所處環境條件的差異，它們之間多少的比例也不同。
