分類
肉聯廠分為清真肉聯廠和大眾肉聯廠兩種。因為宗教信仰的不同，清真肉聯廠在伊斯蘭教的制度下，都嚴格生產清真食品，並由中國伊斯蘭教協會監督生產加工。大眾肉聯廠生產加工各種可供人類食用的肉類。肉聯廠全國各地均有，清真肉聯廠主要集中在北方地區。
分區布局
為了便於管理及流水作業的衛生要求，整個肉聯廠布局一般分為彼此隔離的6個區。
中小型肉聯廠平面布局示例1. 宰前飼養管理區：包括三圈一室，即宰前預檢分類圈、飼養圈、候宰圈、獸醫室。
2. 生產加工區：包括五間一庫，即屠宰加工車間、副產品整理車間、分割車間、肉品加工車間，辦公室、化驗室，冷庫。
3. 病畜隔離區：包括一圈二間，即病畜隔離圈，急宰車間、化制車間。
4. 污水處理區：對畜禽屠宰加工過程中產生的污水進行處理的處理系統。
5. 能源動力區：包括一房兩室，即鍋爐房，供電室、製冷設備室等。
6. 行政生活區：辦公室、宿舍、庫房、車庫、俱樂部、食堂等分為一區。現在稍具有規模的肉聯廠都是另闢生活區。
機構部門
肉聯廠組織機構部門分為以下12個主要部門，及12個部門的職責。
1. 採購部：畜禽的收購，接收從各地運來的的待宰畜禽。
2. 檢疫部：負責獸醫衛生監督檢驗工作，畜禽宰前、宰後的衛生檢驗，確保畜禽來源無疫病。
3. 生產部：負責畜禽加工生產過程操作控制及成品的冷藏保存。保證衛生質量體系有效運行的要求。
4. 質檢部：對出廠前的畜禽產品，加工成品的質量檢驗，要求產品質量符合我國食品安全法律法規體系發相關規定。
5. 銷售部：主要負責畜禽產品的銷售工作，如以進入肉品超市，零售經銷商，自營連鎖超市等方式，有的肉聯廠還向酒店、學校、企業工廠、部隊定點配送。
6. 技術部：負責肉聯廠生產工藝技術的指導、改進，設備的維護、改進，員工規範性操作的培訓等。
7. 產品開發部：研發各種新型肉製品，生化製藥品。
8. 財務部：負責企業資產投資，資金財務預測、財務計畫與財務分析，記帳、報表、納稅及審報等資金流動管理工作。
9. 人事部：負責企業的人力資源工作，包括員工的建立、執行招聘、培訓、考勤、勞動紀律等人事程式或規章制度的建立。
10. 物流部：負責運輸來自四面八方的待宰畜禽，又要將肉製品和副產品等運送到各個需求點，或出口到外國。
11. 後勤部：負責處理廠內及運輸車輛的畜禽糞便、內臟、污物、污水，除塵及定期消毒等工作，以保證車間和運輸車輛的衛生。
12. 綜合管理部：主要是企業的領導層，領導企業文化建設，監督、領導、考核下屬和分管部門工作。確定企業中長期經營目標、經營方針，提供、統籌調配公司資源，制定公司年度經營目標及實現措施。
