這座建築占地3000多平方米,建築物包括大門、圍牆、前殿、中殿、後殿、東船廳、西書樓、明樓、花園、金魚廳等,規模宏大、氣勢磅礴。與百米之遙的“鄭氏祠堂”相比,無論從占地面積還是建築規模都要氣派不少,可見當年這個家族對教育的重視。
屋內的柱子都是選用質地上乘的整根紅木製作,歷經百年依然堅固如初,連釘子都很難釘進去。書室里木雕、石雕、磚雕工藝精湛,圖案精美,代表了當時建築藝術的頂尖水平。文物專家稱,單從建築藝術的角度而言,這裡都稱得上是珍貴的文物。1996年,由省、市文物部門聯合組成的文物專家鑑定組,對綺雲書室進行鑑定時,將其譽為“深圳的陳家祠”,當年綺雲書室被公布為市級文物保護單位