由來
統一聖戰組織最早可以追溯到1990年代。在蘇聯入侵阿富汗後的1990年代後期，扎卡維便在阿富汗赫拉特附近的一所伊斯蘭軍事訓練營開始著手組建這個軍事組織，目標是推翻當時的約旦政府，他認為約旦政府是推行非伊斯蘭化的偽君子；之後該軍事組織很快發展到其他國家，並與基地組織有著極為密切的關係。隨著美軍的進駐阿富汗和塔利班的垮台，該組織在受到重創以後轉移到了伊拉克，在伊拉克，與該國東北部為基地的庫爾德伊斯蘭輔助者組織(Ansar al-Islam,AI) 有密切的關係。美軍占領伊拉克後，“統一聖戰組織”發展成為包括外國參戰者、“伊斯蘭輔助者組織”殘餘和本地的遜尼派穆斯林極端分子組成的專門對抗以美國為首的占領軍和伊拉克當局其他盟友的反叛組織。
領導核心
阿布·艾尤卜·馬斯里 第一代領導核心是扎卡維，他是約旦人也是巴勒斯坦人，2006年6月，被伊拉克安全部隊擊斃。
第二代領導核心是阿布·艾尤卜·馬斯里和巴格達迪。2010年4月，兩人被伊安全部隊擊斃。
基地組織在伊拉克的分支2010年5月16日宣稱，該組織已推舉胡塞尼·庫賴什為“伊拉克伊斯蘭國”的新領導人。
重大事件
2003年11月12日，位於伊拉克南部的納西里耶(Nasiriyah)的義大利憲兵總部遭到自殺炸彈攻擊，造成30人死亡。
2003年12月27日，一次對伊拉克卡爾巴拉(karbala)政府駐地的襲擊造成19人喪生。
2004年
2月19日，位於伊拉克南部小鎮希拉（Hillah）的波蘭駐軍總部遭遇汽車炸彈襲擊，造成10人死亡。
4月9日，26歲的美國人尼克·伯格被綁架並與家人失去聯繫，5月11日，被扣作為人質的伯格斬首錄像在網上播出。 33歲的韓國人金鮮一6月3日以前被扣作為人質，6月23日被斬首。
6月12日，伊拉克外交部副部長庫貝(Bassam Salih Kubba)在前往外交部上班的途中遭遇武裝分子掃射，傷勢過重在醫院死去；6月13日，伊拉克教育部文化聯繫主任卡邁勒·賈拉在同樣情況下被槍手襲擊身亡。
8月24日：發生兩起爆炸事件，襲擊目標分別是伊拉克教育部長薩米·穆扎法爾和環境部長邁什卡特·穆門，兩人都逃過一劫，但造成至少5人死亡。
9月4日，伊拉克北部石油重鎮基爾庫克發生的自殺式汽車炸彈襲擊事件負責。基爾庫克市一所警察學院4日遭遇襲擊，造成20人死亡，36人受傷。
9月5日，在巴格達附近發動了自殺式爆炸襲擊，造成50多名伊拉克軍警和美軍士兵死亡，60多人受傷。
9月6日，“統一聖戰組織”在一個伊斯蘭網站上發表聲明承認，9月6日襲擊了駐伊美軍車隊。美軍官員說，在此次襲擊中，7名美國海軍陸戰隊員和3名伊拉克士兵當場身亡。
9月14日，巴格達市中心一處警察局附近發生汽車炸彈爆炸，至少造成47人死亡，114人受傷。 9月20日，據信“統一聖戰組織”頭目卡維本人在9月20日親手將美國人質尤金·阿姆斯特朗斬首；9月25日，據稱已將被綁架的英國工程師肯尼思·比格利斬首，同時新抓獲了7名英軍士兵作為人質。
2006年
6月7日，領導人扎卡維在美軍空襲中被炸死。
6月12日，伊拉克基地組織在網上發表聲明稱，它已經任命了新的領導人阿布·哈姆扎·穆哈傑爾接替扎卡維。
9月3日，伊拉克國家安全顧問宣布，伊拉克基地組織二號人物哈米德·朱馬·法里德·賽義迪於幾天前被伊安全部隊逮捕。
9月4日，與基地組織有關係的聖戰者協商委員會在網站上發表聲明，否認伊拉克基地組織二號人物被捕，賽義迪不是伊拉克基地組織中的重要人物。
9月14日，伊拉克內政部宣布，伊拉克安全部隊已經擊斃了伊拉克基地組織頭目穆哈傑爾的高級助手阿布·加法爾·利比。
2012年
9月8日與9日，伊拉克各地發生30多起襲擊事件，造成至少88人死亡。基地組織伊拉克分支10日宣稱對伊拉克上周末連環襲擊事件負責。
