細胞標記語言

簡介

細胞標記語言(英語: C ell M arkup L anguage英語縮寫: CellML)。是基於XML的一種標記語言。主要被設計用來描述細胞生物學數學模型功能,類似於系統生物學標記語言用但提供了很大的範圍為模型模組化和重用,並不是特定於描述生物化學。

模型結構

在在其他組件裡頭組件可以連線並使用一個連線元件。CellML模型還允許組件之間的關係來表示,也包括若干組成部分。

關係

包封和遏制。然而更可以用戶自定義。

元素實例

變數和組件

<component name="環境">

<variable name="時間" public_interface="out" units="秒"/>

</component>

連線和接口

<connection>

<map_components component_1="薄膜" component_2="鈉電流"/>

<map_variables variable_1="V" variable_2="V"/>

<map_variables variable_1="i_Na" variable_2="i_Na"/>

</connection>

單位

<units name="秒">

<unit units="秒" />

</units>

<units name="納米">

<unit prefix="納米" units="磯" />

<unit units="公升" exponent="-1" />

</units>

<units name="流">

<unit units="nM" />

<unit units="秒" exponent="-1" />

</units>

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