等密度離心的有效分離取決於顆粒的浮力密度差,密度差越大,分離效果越好,與顆粒的大小和形狀無關。但後兩者決定著達到平衡的速率、時間和區帶的寬度。顆粒的浮力密度不是恆定不變的,還與其原來密度、水化程度及梯度溶質的同透性或溶質與顆粒的結合等因素有關。例如某些顆粒容易發生水化使密度降低。
這種技術根據浮力密度的不同分離物質。其解析度受顆粒性質(密度、均一性、含量)、梯度性質(形狀、粘度、斜率)轉子類型、離心速率和時間的影響。顆粒區頻寬度與梯度斜率、離心力、顆粒相對分子質量成正比。幾種物質可通過離心法形成密度梯度(如蔗糖、葡萄糖、菲可、尼克登)。將樣品與適當的介質混合後離心——各種顆粒在與其等密度的介質帶處形成沉澱區帶。這種方法要求介質梯度應有一定的陡度,要有足夠的離心時間形成梯度顆粒的再分配,進一步離心對其不會有影響。
可以使用一根細的巴氏滴管或帶有細長針頭的注射器來收集某個密度梯度內的條帶。另一種方法可將試管刺穿,將內容物分段逐滴收集到幾個管中。
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