程氏為國內生物製品製造事業創始人之一。在北京任衛生署中央防疫處菌苗室主任(技正)時,主持抗鼠疫血清生產。民國17~26年,任上海市衛生試驗所所長兼技正,負責在江灣籌建規模較大、設備較完善的衛生試驗所,領導研製傷寒霍亂菌苗、狂犬疫苗,並生產牛痘苗應市。民國27年,在上海籌建新亞血清廠任廠長,製造國內急需的痘苗、菌苗及抗毒血清。同年自辦程慕頤醫學化驗所。
1952年,停辦新亞血清廠和醫學化驗所,將所有儀器設備捐獻給國家,入上海生物製品研究所任菌苗室主任、檢定科科長、總技師。任職期間,先後解決了培養基防霉、減少製品雜菌、卡介苗和狂犬疫苗酸鹼度以及白喉類毒素的沉澱等許多技術問題。曾任上海市郊血吸蟲病防治委員會檢驗組副組長,中國微生物學會上海分會常務委員,被聘為中國生物製品法規委員會委員和中國藥典編纂委員會委員。1956年在上海受到周恩來接見和勉勵。著有《細菌學總論》、《細菌學各論》,主編《生物製品的規程》等。