內設機構
根據上述職責，市科技局內設7個職能科室。（一）辦公室
負責局機關後勤工作；管理全系統行政經費、自然科學事業費、科技三項經費；負責機關財務、接待工作。（二）政工科
負責全系統綜合協調、黨務、政務、人事、文秘、扶貧、實績考核、工青婦、體制改革等工作。（三）農牧業科
負責全市農牧業項目的篩選、審核、論證、立項、申報工作，並組織實施、檢查、指導；負責國內外先進農牧業新技術、新成果、新材料的引進、試驗、示範工作；負責全市農村牧區科技培訓工作；負責農牧業科技園區的認定、管理工作；負責農牧業科技方面的調查、統計、規劃編制等工作；組織、牽頭農牧業科技特派員工作的規劃、計畫、總結、督促、指導、協調等工作。（四）高新技術產業科
研究全市工業領域高新技術發展及產業化的政策措施；組織提出工業領域高新技術發展規劃和計畫；組織實施國家、自治區和全市科技攻關計畫、工業領域科技項目、高新技術園區、高新技術產業開發區和工業科技園區的有關工作；組織、牽頭企業科技特派員工作的規劃、計畫、總結、督促、指導、協調等工作。（五）技術市場管理科
貫徹實施有關技術市場的法律、法規，管理監督全市技術貿易機構，進行年度檢查，培育全市技術市場，發展科技中介組織，幫助民營科技企業和各類民營科技服務組織的建立和審核，對各類技術貿易機構實行監督檢查，規範服務功能和質量，檢驗技術貿易證書，進行技術貿易情況的統計、分析、上報等工作。組織、申報、實施社會領域的國家、自治區重大科技計畫、科研項目；組織、管理、指導社會領域的科技工作；承擔社會領域的醫藥衛生、節能減排、循環經濟方面的科技工作以及協調、聯繫863計畫的組織、申報、管理工作；負責自然科學基金計畫及基礎研究規劃方面的工作。（六）智慧財產權科
貫徹執行國家關於智慧財產權有關工作的方針政策、法律法規，研究提出加強我市有關智慧財產權保護工作的措施辦法；做好有關智慧財產權必要的協調工作；研究制定我市專利工作發展規劃和專利信息網路規劃，並組織實施；負責全市專利轉讓、制定有關專利工作的教育與培訓規劃；負責有關專利和智慧財產權的統計和檔案管理等工作；負責全市科技獎勵工作。（七）計畫成果管理科
研究全市科技發展戰略，編制全市中長期科技發展規劃和科技項目計畫；負責全市各類科技計畫的協調和配置；負責各類科技計畫的呈報、下達、匯總、驗收、統計；負責全市科技成果的鑑定、驗收、評審、登記。領導班子
黨組書記、局長廖培根：主持局黨組、行政全面工作，分管辦公室。黨組成員、副局長俞亞萍：協助書記（局長）分管組織人事、廉政建設、宣傳(精神文明)、統戰、群團、黨支部、退休幹部、綜治信訪、農社科技、科技合作，智慧財產權（專利）、技術市場、科技成果(獎勵)、科技中介、科技人才、防震減災、國防動員及科技支前保障、招商引資等工作，分管科技合作科（智慧財產權管理辦公室）、區防震減災辦公室、綜合科技服務中心。
副局長趙平：協助局長分管財務、科技規劃、科技法規、科技政策、科技宣傳（政務及外宣）、科技考核、工業科技企業、工業科技(科技孵化器)、科技統計、鎮(街道、秀洲新區工業園區)科技管理、科普、電子政務(信息化)、保密、檔案等工作，分管綜合計畫科。
局黨組紀檢、局監察工作納入歸口紀工委管理。
