八旗兵入關不久開始腐化。綠營兵亦日趨腐朽。鴉片戰爭後，綠營迭經裁汰，僅存虛名。清政府先後建立湘軍、淮軍、新水師(海軍)和新建陸軍，作為取代八旗、綠營的正規軍。
綠營兵
督 標
總督閩浙提督軍務，簡稱閩浙總督，正二品官(加尚書銜者為從一品)。原轄閩浙二省。雍正五年(1727年)十二月奉令專轄福建，雍正十二年奉令兼轄浙閩。光緒十一年(1885年)裁福建巡撫，總督兼巡撫事。閩浙總督駐福州，其公署稱總督部院，在布政司之南稍西(今省府路)，屬官編制不見記載。轄本標中、左、右三營、水師營。在閩省節制撫標一，水、陸提標各一，鎮標八。 督標中營由副將統領，有官兵958人；左、右營均由參將統領，各有官兵971人。均駐防福州。督標水師營由參將統領，有官兵906人，戰船6艘、哨船4艘，駐防福州南台。撫 標
福建巡撫提督軍務，為從二品官(兼兵部侍郎銜者為正二品)，順治元年(1644年)置，駐福州。是本省地方行政長官，綜理全省軍政，其公署為巡撫部院，在嵩山之麓。轄本標左、右營。左營由參將統領，有官兵803人；右營由游擊統領，有官兵708人。均駐防福州。福州城守協
隸屬於福建陸路提督軍務總兵官。嘉慶十三年(1808年)改為兼理軍標綠旗營(即福州城守營)。由副將1人統領，駐仙塔街，轄左軍、右軍(亦稱左右營)各1。左營由都司統領，有官兵1247人，駐紮福州城，雍正十一年(1733年)移駐南台，分防閩縣、古田、閩清、屏南等縣地。右營兼軍標，由都司統領，有官兵1401人，駐福州城，分防侯官、閩清、永福(今永泰)等縣地。長福營
原屬興化城守協，雍正九年(1731年)改歸陸路提督管轄。由參將一員統領，駐福清縣，轄左軍、右軍各一。左軍由守備統領，有官兵552人，駐鎮東衛城。右軍由都司(原為守備，雍正十年改)統領，有官兵467人，駐長樂縣。福寧鎮連江營羅源營
連江營由游擊(駐連江縣城)、守備各1人統領，有官兵657人，駐防東岱堡，分防連江各汛。羅源營由游擊、守備各1人統領，有官兵657人，駐防羅源縣城，分防羅源各汛。
