有兩種神經遞質轉運蛋白對神經傳遞起著重要作用.一種是起著攝取載體(uptake carrier)作用的轉運蛋白,位於突觸前神經元與漿細胞內,將神經遞質從細胞外間隙泵入細胞內.它能補充神經遞質的供應,幫助終止神經遞質的作用,對谷氨酸而言能使其數量保持在毒性水平以下.這些泵所需的能量都是由ATP提供.另一種轉運蛋白位於遞質囊泡的膜上,能使神經遞質集中進入囊泡,以備進一步胞裂外排.這些轉運蛋白的動力來自胞漿的pH與囊泡膜內,外的電壓梯度.當缺氧和缺血時,經膜的離子梯度發生變化,谷氨酸從囊泡被轉運進入胞漿,使細胞內谷氨酸的濃度達到可以致死的水平.
第二信使系統是由起調節作用的G蛋白與起催化作用的一些蛋白(如腺苷酸環化酶和磷脂酶C)所組成,在受體與效應器之間起到聯接的作用.一個第二信使可以是某一連鎖反應的促發者,或者是某一調節通路的靶目標 。