檔案系統是作業系統與驅動器之間的接口,當作業系統請求從硬碟里讀取一個檔案時,會請求相應的檔案系統(FAT 16/32/NTFS)打開檔案。扇區是磁碟最小的物理存儲單元,但由於作業系統無法對數目眾多的扇區進行定址,所以作業系統就將相鄰的扇區組合在一起,形成一個簇,然後再對簇進行管理。每個簇可以包括2、4、8、16、32或64個扇區。顯然,簇是作業系統所使用的邏輯概念,而非磁碟的物理特性。
為了更好地管理磁碟空間和更高效地從硬碟讀取數據,作業系統規定一個簇中只能放置一個檔案的內容,因此檔案所占用的空間,只能是簇的整數倍;而如果檔案實際大小小於一簇,它也要占一簇的空間。所以,一般情況下檔案所占空間要略大於檔案的實際大小,只有在少數情況下,即檔案的實際大小恰好是簇的整數倍時,檔案的實際大小才會與所占空間完全一致。