軟骨硬鱗魚次亞綱又稱硬鱗魚類(Ganoid)。輻鰭魚中最原始的一類。內骨骼多為軟骨,體被斜方形堅厚硬鱗。上頜骨參與頰部的組成,與前鰓蓋骨固著聯結,口裂深,口緣具錐形齒。
各鰭鰭條很多,單背鰭與腹鰭靠近身體的後部,歪型尾。軟骨硬鱗魚類包括古鱈目、多鰭目及鱘目。泥盆紀至現代,晚古生代及中生代初期繁盛,新生代衰落,只有少數代表如鱘、白鱘、多鰭魚等延續至今。中國軟骨硬鱗魚類化石有吐魯番鱈(Turfania)、中華扁體魚(Sinoplatysomus)、北票鱘(Peipiaosteus)、原白鱘(Protosephurus)等。