成書背景
馬印麟認為，自古以來張仲景、劉河間、李東垣、朱丹溪可謂岐黃之四大明師，但“惟有瘟疫一門而未嘗發明受病之由”。導致“凡遇瘟疫之症，流行顛倒差亂，誤人多多。”後來，馬氏在青州醫藥世家張宗玉處得其所藏張景岳《類經》，對其中的五運六氣之說十分賞識，認為如果能明五運六氣之至要，則可知為瘟疫時症之根源，故書名為《瘟疫發源》。此書成書之後，存放了三十餘年，在此期間馬氏注意觀察運氣與瘟疫發生的關係，認為是“屢驗屢效”，所以才將此書刊刻出版，並將觀察結果附在書前。
流傳版本
目前《瘟疫發源》存世只有雍正三年的初刻本。
作者簡介
馬印麟，字長公，號好生主人，古青（今山東益都）人。據其《瘟疫發源》雍正三年（1725年）自序署名“三世醫八十老人馬印麟”，其生年當為1645年。而其90歲時（1735年）還出版了最後一部著作《救急良方》，其逝年當不早於此年。馬氏三世業醫，自幼隨祖父學醫。父輩去世後，又“各處訪求明師賢友”。對瘟疫的診治頗有體會，遂成《瘟疫發源》一書。
書評、序言
《瘟疫發源辨論》序
醫之為道，蓋自上古神聖，參天地陰陽之秘，以躋一世於和平，其功最大。自後世儕於方技之列，痛夫俗子鹹托業於其間，以為衣食計，品益雜，技日疏，幾以人為費而醫之道隱矣。古人有言“不為良相則為良醫”，醫豈易言哉?北海馬君長公，當代良醫也。嘗往來歷下，與余交甚久。每見其治療奇驗，真所謂“飲上池之水而洞見垣一方”者。其品高行粹，淹博儒雅，蓋隱君子者流姑托跡於是，豈與世之碌碌者同乎一日?出其所著《瘟疫發源辨論》二冊示余，約而該，微而顯，辨析毫芒，治法畢具，至哉!書乎。余嘗歷覽古今來所刻方書，於疫癘一途詳者或鮮。蓋諸症或出於人事，而此症則本乎天行，使非通於陰陽五行之理，而究極其微，或爽毫釐，誤人非細。今觀是書，五運六氣，洞徹條貫，造化根心調燮在手，能使垂沴之氣變為甘雨和風，厥功偉矣。是書之行，誠足以上繼古來神聖濟世之心，寧僅曰方伎家言而已哉?因樂弁數語於首，以告夫世之讀是書者。
時雍正二年歲次甲辰長至日平陵楊瑄序於倩月山房
自序
予年八十歲，細自數十歲時受祖父之岐黃醫業，從師訓讀數載。父亡之後，各處訪求明師賢友，講究議論。至於前輩如東垣、丹溪、河間、仲景四大明師岐黃，將諸病、脈理、經絡臟腑、本草無不注釋，詳悉明白，惟有瘟疫一門而未嘗發明受病之由。諸家雖有數句，至簡至約，不甚詳細，悶懷心腹二十餘年。凡遇瘟疫之症，流行顛倒差亂，誤人多多。忽而青州，宗玉張公，亦是世家岐黃，所積之書，賜《類經》一部，四十餘冊。朝夕晝夜苦讀窮究，黃帝與岐伯注天文地理，人事三才，其書理義深遠，繁多難讀，蓋學淺不能便覽。吾將瘟疫一門，由博返約，採集一冊，名曰《瘟疫發源》，使後人便易入門。至今三十餘年，屢驗屢效。方敢刊刻濟人。所驗之年歲，略表一二，開例於下，以使後學誠信。再求高明指示。
雍正三年歲次乙已古青三世醫八十老人馬印麟甫纂
《瘟疫發源》小引
夫醫學源自伏羲，傳之神農，注於皇帝。故軒轅與岐伯參酌天地陰陽，化生六氣，運行一歲十二月之間。分布在人，為手足三陰三陽十二經，左右要會，作八十一篇，垂為世范，至今用之而為醫家繩墨規模者也。粵自黃帝之後，二千五百餘年。漢長沙張仲景先生恤於民命多被傷寒瘟疫損害橫夭，因而詳考古經函微之玄機，氣運主客之遷變，以著《傷寒卒病方論》一十六卷，使後之學者有可依據。仲景迄今又千餘載，凡著作醫書遏往古者八九倍矣。然皆究其末而不求其本。青齊長翁馬先生堯善岐黃，洞徹奧秘，千經百論，無不探本窮源。其手著《瘟疫發源辨論》上下卷，發明五運六氣之至要，為瘟疫時症之根源。其言簡，其理明，易於習誦，使人知所由來，其用心可謂深且大矣。誠靈書之纂要，後學之指迷，瘟疫之秘訣，生人之厚幸耶。桓毫末無知，不自揣其鄙陋，妄筆而志之，幸勿哂其俚劣雲。
時雍正三年歲次乙已蒲月上浣之吉
古燕同學弟余東桓敬遠氏識於濼濱倩月齋之西堂
章節目錄
瘟疫則驗
瘟疫治法表其大略
瘟疫病按
五運六氣瘟疫發源
五運詳註
六氣詳註
六氣分主客
司天在泉左右間氣
司天在泉解
五運詳註原病
六氣天時民病
五運五郁天時民病詳解
禹貢九州分野八卦定位
十二地支方位
五運六氣藥方
內容簡介
《瘟疫發源》選取張景岳《類經》中關於五運六氣的內容，預測每年的主氣與客氣“和”或“不和”。馬印麟指出“凡主氣者，年年不移。客氣者，每歲而迭遷”，所以他以乾支年為序，逐年分析此年的主客之氣、歲運特點，以及氣候、物產與疾病。通過這種推算，預測某年可能有瘟疫流行而早做準備。他認為“若主客之氣正化，則天時風雨調和而五穀豐收，則民亦舒而無病。然一歲之中，全在客氣之流行變化。若主客之氣不和，陰陽不得升降，則五行相制，天時寒熱溫涼，不應主氣，則天有不測之氣象，風雲雷雨，旱澇不均。五穀亦不能豐收，而民多患災難疫癘之熱症。”並對氣運不同的不同年份提出了相應的不同治法，最後提出7個藥方，用於不同氣運年的瘟疫防治。
影響評價
《瘟疫發源》 是一部明清以來較為實用的運氣學、溫病學著作，然而成書以來刊刻甚少，流傳不廣，實與運氣學說晦澀難通有極大關係。
