使命
疾病預防控制中心在我國歷史上，傳染病曾經是嚴重威脅人民健康和生命安全的疾病。上世紀50年代，因傳染病和寄生蟲病死亡人數居於全國人口死因中的第一位。經過多年的努力，目前下降到第9位，並在開發中國家中率先消滅了天花和脊髓灰質炎等重大傳染病。我國雖然是一個自然災害頻繁的國家，但多年來成功地實現了大災之後無大疫。2003年戰勝了來勢兇猛的非典疫情，近兩年又成功地控制了禽流感向人類的傳播。目前，全國正在建立健全愛滋病、結核病、血吸蟲病、B型肝炎等嚴重傳染病的預防控制和醫療救治體系。據2004年30個市和78個縣(縣級市)死因統計，城市居民前十位死因為：①惡性腫瘤126.4/10萬，②腦血管病100.9/10萬，③心臟病99.4/10萬，④呼吸系病69.3/10萬，⑤損傷及中毒31.1/10萬，⑥消化系病17.1/10萬，⑦內分泌、營養和代謝疾病14.9/10萬，⑧泌尿生殖系病9.5/10萬，⑨神經系病4.6/10萬，⑩圍生期病168.5/10萬活產，前十位死因合計占死亡總數的90.1%。農村居民前十位死因為：①惡性腫瘤119.7/10萬，②腦血管病74.9/10萬，③呼吸系病67.2/10萬，④心臟病63.4/10萬，⑤損傷及中毒33.5/10萬，⑥消化系病14.2/10萬，⑦內分泌、營養及代謝疾病12.7/10萬，⑧泌尿生殖系病8.1/10萬，⑨圍生期病363.9/10萬活產，⑩肺結核3.3/10萬。前十位死因合計占死亡總數的79.3%。
基本職責
1、為擬訂與疾病預防控制和公共衛生相關的法律、法規、規章、政策、標準和疾病防治規劃等提供科學依據，為衛生行政部門提供政策諮詢。
2、擬訂並實施全國重大疾病預防控制和重點公共衛生服務工作計畫和實施方案，並對全國實施情況進行質量檢查和效果評價。
3、指導建立國家公共衛生監測系統，對影響人群生活、學習、工作等生存環境質量及生命質量的危險因素，進行營養食品、勞動、環境、放射、學校衛生等公共衛生學監測；對傳染病、地方病、寄生蟲病、慢性非傳染性疾病、職業病、公害病、食源性疾病、學生常見病、老年衛生、精神衛生、口腔衛生、傷害、中毒等重大疾病發生、發展和分布的規律進行流行病學監測，並提出預防控制對策。
4、參與和指導地方處理重大疫情、突發公共衛生事件，建立國家重大疾病、中毒、衛生污染、救災防病等重大公共衛生問題的應急反應系統。配合併參與國際組織對重大國際突發公共衛生事件的調查處理。
5、參與開展疫苗研究，開展疫苗套用效果評價和免疫規劃策略研究，並對全國免疫策略的實施進行技術指導與評價。
6、研究開發並推廣先進的檢測、檢驗方法，建立質量控制體系，促進全國公共衛生檢驗工作規範化，提供有關技術仲裁服務，受衛生部認定，開展健康相關產品的衛生質量檢測、檢驗，安全性評價和危險性分析。
7、建立和完善國家級疾病預防控制和公共衛生信息網路，負責國內外疾病預防控制及相關信息蒐集、分析和預測預報，為疾病預防控制決策提供科學依據。
8、組織實施全國性重大疾病和公共衛生專題調查，為國家國民經濟與社會發展規劃公共衛生戰略的制定提供科學依據。
9、開展對影響國家社會經濟發展和國民健康的重大疾病和公共衛生問題防治策略與措施的研究與評價，推廣成熟的技術與方案。
10、組織實施國家級健康教育與健康促進項目，指導、參與和建立國家級社區衛生服務示範項目，探討社區衛生服務的工作機制，推廣成熟的技術與經驗。
11、負責農村改水、改廁工作技術指導，研究農村事業發展中與飲用水衛生相關的問題，為有關部門做好飲用水開發利用和管理提供依據。
12、組織和承擔與疾病預防控制和公共衛生工作相關科學研究，開發和推廣先進技術。
13、負責對下級疾病預防控制機構人員的培訓。
14、開展國際合作與技術交流，引進和推廣先進技術。
15、承擔衛生部交付的其他工作任務。
相關職責
傳染病:流行性出血熱炭疽結核病血吸蟲病等。
突發公共衛生事件:洪災 旱災 震災 震災防病等。
慢性非傳染性疾病：腫瘤糖尿病等。
疫苗與接種 ：免疫程式 疫苗研究進展 免疫規劃傳播材料等
生物安全 ：國際交流 實驗室安全周 培訓 實驗室安全簡報
此外，還包括：兒少/學校衛生 ，老年保健 ，健康促進 ，婦幼保健 ，放射衛生 ，環境衛生 ，職業衛生與中毒控制，營養與食品衛生等方面。
科技成果
《食品中有機錫超痕量檢測用設備的改造》課題通過科技部驗收
二惡英、多氯聯苯和氯丙醇的痕量與超痕量檢測技術的研究
中國居民膳食結構與營養狀況變遷的追蹤研究
新疆出血熱病毒分子特徵研究及診斷方法建立
呼吸道吸入天然釷（Tho2）和稀土礦塵聯合作用的研究
肺癌危險度與室內氡關係研究
糞尿分集式生態衛生廁所在中國套用與推廣可行性研究
食品真菌安全性檢測及評價技術研究
茶葉防癌有效成分及作用機制研究
一種引起腦炎、無名熱的新病毒-Colti病毒的發現
X射線診斷的系列防護標準與相關放射防護用品的研製及推廣套用
食品污染物監測極其對健康影響評價的研究
呼吸道吸入天然釷（Tho2）和稀土礦塵聯合作用的研究
禽H9N2亞型流感病毒感染人的發現及其意義
食物殘留物的檢測技術研究
我國食物碳水化合物營養學分類及血糖生成指數的基礎和套用研究
我國主糧中伏馬菌素污染及串珠鐮刀菌分子生物學研究
腸出血性大腸桿菌O157:H7的流行病學調查和控制措施研究
痢疾桿菌全基因組序列測定和分析
我國煤煙型大氣污染對人群健康危害的定量研究
微量營養素補充對孕婦健康及胎兒和兒童生長發育的影響
“九五”期間全國醫療照射水平調查研究
