傳統意識
在19世紀合成藥物問世之前，畲族人民與世界上的2000多個民族一樣，都是採用草根樹皮、蟲豸殼石等天然動植物來防治疾病。即使在合成藥物廣泛用於臨床以後，傳統醫藥在民間仍占有一定的地位。特別是近些年來，由於醫學模式的改變、疾病譜的改變、社會老齡化的加快，再加上合成藥物的臨床毒副作用日趨明朗化和醫源性、藥物性疾病日益增加，返璞歸真，回歸大自然，還我綠色藥物的呼聲又高漲起來，並逐漸成為人們的共識。
醫學理論
前提畲族民間醫藥使用的是純天然藥物，基本上沒有加工成丸、散、膏、丹。畲族醫藥是畲族人民幾千年來與疾病作鬥爭的實踐經驗總結，儘管尚未形成完整的民族醫藥理論體系，但有其本民族認識生命的觀點和獨特疾病觀、疾病分類法等特點。
基礎畲醫認為，人的生命是由心、肝、肺、脾、腎、膽六髒的“神”來主宰，通常簡稱為“六神”。六神按時辰各司其職，周而復始，循環不息。若傷其一種，一般症狀為定期畏冷，甚至寒戰，但不發燒，每天定期發作，逐日畏冷寒戰症狀減輕而卻感更加疲乏無力、精神萎靡、厭怠等症狀加劇。每一“神”受到傷害都會出現每一“神”的特有症狀，如傷到“心神”，則出現發笑不止(狂笑)或無故啼哭不停，甚至發狂等；傷了肺神，則咳嗽不止，甚至失聲、咳血等；傷到肝，則出現全身發黃，甚至臌脹等；傷到腎，則尿頻尿急，膀胱脹滿而排不出尿，或小便失禁或一直有排尿感等；傷到脾，出現食欲不振，膈呃，甚至嘔吐、嘔血等；傷到膽，心事不寧，擔驚受怕，稍有響動，則心驚肉跳，眼睛一閉就會感到大難臨頭而大喊大叫起來等。“六神”受傷要及時用“六神草”治療，若治不及時或治不當者，則愈演愈烈，甚至危及生命。
臨床套用畲醫還認為，人體有36骨節，72筋脈，12條血路，28脈，依靠氣血筋脈來維持生命，人體氣血旺盛，筋脈順暢，生命活動就正常，人的身體就健康。若氣血不足，筋脈不暢，人的身體就贏弱；若氣血不調，或氣血衰弱，筋脈滯阻，瘟邪侵蝕，則疾病發生；如氣竭血枯，筋痙脈止，則生命活動就停止。畲醫用藥也遵循“寒者熱之、熱者寒之”的基本法則，且特別重視患者體質的熱或冷；有 的畲醫不管熱與寒，都用一種(類)草藥。藥品是以植物藥為主的自然藥物，且多為鮮品，一般是現采現用，也用乾品，常以雞、鴨、豬腳、豬肚、豬心、豬肺、豬肝、豬肉、糯米、紅酒、紅棗、紅糖、白糖或冰糖等佐之，有的還用蔥、姜等佐之，用藥有的用單味的單方，也有用多味的複方。用藥講究新鮮，隔年藥一般不用；多數以原生藥，少數經過特別的加工炮製；多數將原生藥搗爛是為了保密，怕技術外傳。常用畲族藥有300多種，其中有10多種已收人《全國民族藥志》一、二卷中。畲醫治病服藥講究時間與忌口，用藥劑量都比較大。
