研究領域
1.微生物代謝工程：用基因工程法生產大宗或高值化學品，包括3-羥基丙酸、1,3-丙二醇、丙烯酸等C3化合物、新材料聚3-羥基丙酸以及新維生素吡咯喹啉醌等高值化學品。
2.合成生物學：以發酵產量為目標的代謝途徑耦合強化、細胞邏輯重構、群體感應等。
3.套用微生物選育及發酵條件最佳化。
4.生物農藥：天然抗菌活性成分篩選及劑型製備。
科研項目
主持國家自然科學基金面上項目3項，主持863子課題1項，參加973項目1項。在國內外期刊發表論文90多篇。
主編教材
《分子生物學與基因操作技術》，參編國家十一五規劃教材《生物化學》（教育部精品教材）。從事工業微生物代謝調控和合成生物學研究，包括細胞邏輯重構、代謝模組控制和群體感應。
社會兼職
ApplEnvirMicrobiol, Mol Genet Genomics, CurrMicrobiol,J MolCatal B-Enzym等10多種SCI期刊審稿人，擔任國家自然科學基金項目評審專家。
在研項目
圍繞上述研究方向，主持國家自然科學基金項目3項：基於全局轉錄機器工程生產3-羥基丙酸及其調控機理 ，遞進式強化新型維生素吡咯喹啉醌的生物合成途徑 ，新材料聚3-羥基丙酸信號工程菌構建及其代謝流邏輯切換 。主持863項目（1,3-丙二醇生產菌的遺傳改造）和參加973項目（生物材料合成新途徑構建）。
論文著作
1) Enhanced Aldehyde Dehydrogenase Activity by Regenerating NAD in Klebsiella pneumoniae and Implications for the Glycerol Dissimilation Pathways. Biotechnol Lett, 2013,35(10): 1609-1615 (corresponding author)
2) Engineered Constitutive Pathway in Klebsiella pneumoniae for 3-Hydroxypropionic Acid Production and Implications for Decoupling Glycerol Dissimilation Pathways. Curr Microbiol, 2013, 66(3): 293-299 (corresponding author)
3) Distinct Promoters Affect Pyrroloquinoline Quinone Production in Recombinant Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae. Curr Microbiol, DOI: 10.1007/s00284-014-0607-7(corresponding author)
4) NAD-independent Aldehyde Oxidase Catalyzes Cofactor Balanced 3-Hydroxypropionic Acid Production in Klebsiella pneumoniae. Biotechnol Lett, 2014, DOI: 10.1007/s10529-014-1590-6(corresponding author)
5) Gene arrangements in expression vector affect 3-hydroxypropionic acid production in Klebsiella pneumoniae. Indian J Microbiol, 2013, 53(4): 418-424 (corresponding author)
6) Heterologous expression of aldehyde dehydrogenase from Saccharomyces cerevisiae in Klebsiella pneumoniaefor 3-hydroxypropionic acid production from glycerol. Indian J Microbiol, 2012, 52(3): 478-483(corresponding author)
7) Disease control during peach preservation with a berberine-chitosan composite membrane. Fruits, 2012, 67(4): 277-284 (corresponding author)
8) Classifying the DNA assembly protocols for devising cellar architectures. Biotechnol Adv, 2011, 29(1): 156-163(corresponding author)
9) Berberine as a natural compound inhibits the development of brown rot fungus Monilinia fructicola, Crop Prot, 2010, 29, 979-984(corresponding author)
10) Overview of the Rim2/Hipa Superfamily: Structure, Distribution, Transposition and Utilization. Prog Nat Sci, 2008, 18(4): 375-379 (corresponding author)
11) Production of 1,3-propanediol from glycerol by recombinant E. coli using incompatible plasmids system. Mol Biotechnol, 2007, 37(2): 112-119
12) Heterologous Expression and Characterization of Recombinant Glycerol Dehydratase from Klebsiella pneumoniae in Escherichia coli. Biotechnol J，2007, 2(6): 736-742
13) Expression of various genes to enhance ubiquinone metabolic pathway in Agrobacterium tumefaciens. Enzyme Microb Technol,2007, 41(6-7): 772-779
14) Phenotypesandfed-batchfermentationofubiquinone-overproducingfissionyeastusingppt1gene. JBiotech, 2007, 128:120-131
15) Genomic variation of the rice Rim2/Hipa superfamily and dendrogram and fingerprinting analysis of rice germplasm based on Rim2/ Hipa paralog display. Prog Biochem Biophysics, 2006, 33(2): 169-177（first author）
16) Progress in Plant CACTA Elements, Acta Genetica Sinica, 2006,33(9): 765-774（ 一作及通訊）
17) Genomic characterization of Rim2/Hipa elements reveals a CACTA-like transposon superfamily with unique features in the rice genome. Mol Genet Genomics. 2003, 270(3): 234-42.（first author）
18) Cloning of a novel big rice TE and its structural comparison with CACTA elements. J Zhejiang Univ, 2004, 30(2): 133-140（first author）
19) 羧酶體結構及其CO濃縮機制研究進展, 生物工程學報，2014, 30(8): 1164-1171 ( 通訊 作者 )
20) 肺炎克雷伯氏菌3-羥基丙酸合成關鍵酶基因過表達與NAD再生的耦合， 北京化工大學學報，2014, 41(1): 74-77 ( 通訊 作者 )
21) 三種不同磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因的克隆、表達及其對宿主菌生長的影響. 北京化工大學學報，2014, 41(2):87-92 ( 通訊 作者 )
22) 基於重組大腸桿菌無細胞體系生產吡咯喹啉醌， 生物技術通報，2014, 4, 164-168 ( 通訊作者 )
23) 基於全局轉錄工程促進肺炎克雷伯氏菌吡咯喹啉醌的生物合成, 北京化工大學學報，2014, 41(3):92-96 ( 通訊 作者 )
24) 吡咯喹啉醌生產菌的發酵條件最佳化， 北京化工大學學報，2013, 40(5): 88-92 ( 通訊作者 )
25) 大腸桿菌中插入表達信號肽提高吡咯喹啉醌產量的研究， 北京化工大學學報，2013, 40(增刊):32-35 ( 通訊作者 )
26) 過表達醛脫氫酶對 Klebsiella pneumoniae 合成3-羥基丙酸的影響， 北京化工大學學報，2013, 40(6): 72-75 ( 通訊作者 )
27) 小檗鹼和多菌靈復配增強對桃褐腐病菌的抑制效果， 北京化工大學學報，2013, 40 (1): 89-92 ( 通訊作者 )
28) 桃褐腐病菌角質酶基因的克隆與原核表達， 北京化工大學學報，2013, 40(2): 61-64 ( 通訊作者 )
29) 磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因的克隆與原核表達, 北京化工大學學報，2012, 39 (5): 98-101（ 通訊作者）
30) 基於sigma因子全局代謝擾動提高克雷伯肺炎桿菌的3-羥基丙酸產量, 北京化工大學學報，2012,39(4):72-76（ 通訊作者）
31) 大腸桿菌葡萄糖脫氫酶基因的克隆與原核表達. 北京化工大學學報，2012, 39(1): 68-71（ 通訊作者）
32) 增塑劑對殼聚糖-小檗鹼複合膜物理和抗菌性能的影響. 北京化工大學學報，2011, 38(5): 100-104（ 通訊作者）
33) KEGG資料庫、工具及其在生物合成中的套用. 生物技術通報, 2011, 1, 76-82（ 通訊作者）
34) 產甘油重組大腸桿菌的構建及耐高滲透壓性能測定， 北京化工大學學報，2011, 38(6): 93-97 （ 通訊作者）
35) 兩種消除 Klebsiella pneumoniae重組型質粒的方法. 北京化工大學學報. 2010, 37(6): 112-115.（ 通訊作者）
36) 酵母菌發酵川烏、附子的初步研究. 時珍國醫國藥, 2010, 21(4): 816-818 通訊作者）
37) 酶催化合成維生素C脂肪酸酯的反應條件最佳化. 北京化工 大學學報, 2009, 36(6): 77-81（ 通訊作者）
38) 小檗鹼和殼聚糖抗蔬菜病原真菌活性測定及複合膜製備. 北方園藝, 2009, 8, 131-133（ 通訊作者）
39) 小檗鹼殼聚糖微球製備及其抗病原真菌活性測定. 過程工程學報, 2008, 8(5): 962-966（ 通訊作者）
40) 獸疫鏈球菌磷脂醯甘油磷酸合成酶基因的分離. 北京化工大學學報, 2008, 35(5): 78-81（ 通訊作者）
41) 鏈球菌生物合成透明質酸的分子機理與基因工程菌構建進展. 中國生物工程雜誌 , 2008,28(4):98-102（ 一作）
42) 遺傳改造 Klebsiella pneumoniae提高1,3-丙二醇產量的研究進展, 化工進展，2008, 27(3): 322-325（ 一作）
43) 淡豆豉、黃大豆及黑大豆體內外抗蛋白非酶糖化作用研究， 食品科學,2008, 29(10): 557-559（ 通訊作者）
44) 四種中藥提取物對蔬菜病原真菌的抑制作用. 北方園藝, 2008, 2: 222-224（ 通訊作者）
45) 甘油歧化為1,3-丙二醇的代謝及關鍵酶研究進展， 生物工程學報，2007, 23(2): 201-205（ 一作）
46) 大豆及其有效成分體外抗蛋白非酶糖化作用， 食品科學, 2004,25(12): 61-64（ 一作）
47) 病原菌誘導轉錄的水稻 Rim2轉座酶編碼亞組的結構與分布， 植物生理與分子生物學報，2003, 29 (3): 257-264（ 一作）
48) 田平芳等，一種抑制桃褐腐病菌的緩釋微囊及複合膜的製備方法，專利號：200910087176 公開（公告）號：101574083 公開（公告）日：2009/11/11
49) 專利：1. 基於水稻超級基因家族的品種分子指紋技術。2.一種抑制桃褐腐病菌的緩釋微囊及複合膜的製備方法
50) 參編《生物化學》 高教出版社，教育部精品教材
