生物計算平台
生物計算需要進行海量數據的分析，科研工作者或企業研發人員往往需要藉助專門的平台來實現，如北京市計算中心生物計算平台和華南理工大學高性能格線計算平台、西安交通大學生物計算平台等。這些平台具有性能強大的硬體系統，並整合整合生物信息學軟體及分析工具，可以高效完成數據分析工作。
生物計算工具
1. 數據處理軟體
①CrossGraphs2.1。專門設計用於在醫學、藥學和生物學方面的多變數資料庫圖形顯示軟體，可以將Oracle等資料庫，或者數據文本檔案轉化為各種圖形輸出，以便進行各種統計分析。CurveExpert1.34。對ELISA標準曲線擬合頭痛嗎？實際上，不只是ELISA標準曲線擬合，其它各種有關的實驗數 據分析，都可以套用。
②CurveExpert進行數據分析。它使用非常方便，可以說是實驗數據處理的聖手，並且可以生成漂亮的曲線套用到論文之中。
2. 序列綜合分析等
① Phylip。PHYLIP 3.5c 用來進行進化樹分析。三個自解壓軟體包括了說明檔案與C語言原代碼。它可以分析DNA與蛋白序列， 限制位點等，並可繪製進化樹。程式含有許多選項可以精確控制與分析。
②tree-puzzle5.0。核酸序列、蛋白序列相似性分析及進化樹構建工具。根據序列數據的最大相似性構建進化樹，可對大量數據進行快速分析構建，程式還包含數個統計測試。解壓後，有詳細使用手冊及程式原始碼。
生物計算數據集
生物計算產生了海量單變數或多變數的數據集，構成了生物計算研究的基礎數據，如：EMBL Nucleotide Sequence Database(EMBL核苷酸序列數據集)、BioGRID Dataset v3.1.85(BioGRID數據集v3.1.85)、CATH database V3.4(CATH蛋白結構分類資料庫-版本3.4)、The molecular signature CEL files (B chip)、Gene Expression Correlates of Clinical Prostate Cancer Behavior等。
