定義
生物信息學分析平台是將各種生物信息學分析軟體集成起來，通過網頁或者命令行的方式進行核酸和蛋白序列分析的平台。
已有生物信息分析平台
Galaxy分析平台
Galaxy是一個開放的基於網頁的生物信息分析平台，目前已經部署投入使用的公共Galaxy分析平台約有30個。通過該平台，能夠在不下載和安裝任何軟體和工具的前提下做各種生物信息學分析，並能夠記錄每一步分析過程，同時可以與其他科研人員分享分析的歷史記錄和構建的工作流。比如，由國家基因庫搭建、配置和維護的公共開放的Galaxy平台，可以為國內外用戶提供運算存儲資源和流程化分析服務，它整合了各種生物信息學分析工具，可以友好方便的構建生物數據分析工作流，是集數據上傳檢索及處理、序列比對組裝、序列分析、SNP/WGA分析、數據可視化等眾多生物信息分析功能於一體的公共開放性平台。
GenePattern分析平台
GenePattern生物分析平台提供了用於基因組，RNA-SEQ，蛋白質組，SNP分析，與及常見數據處理分析的150多個分析工具，並且該平台具有word外掛程式，可以將分析流程添加到doc文檔中。
DNAnexus分析平台
DNAnexus生物分析平台主要側重下一代測序技術的信息分析，部分功能可免費使用。DNAnexus生物分析平台是致力於打造雲端數據分析平台，2011年獲GoogleVentures和TPGBiotech投資，DNAnexus將和Google一起建一個開放式DNA資料庫，而取代美國政府的國家生物技術信息中心（NCBI），該平台最大的特點是使用google的雲服務，將數據存在雲端，科研人員可通過軟體即服務訪問這些數據。
