個人經歷
博士生導師,研究員。截止2013年6月,己發表SCI論文60餘篇,Google scholar 統計引用達2000餘次。
1994年,她以630分的優異成績成為綏化市高考理科狀元;
1998年,獲南開大學生物學學士學位;
2000年,獲香港科技大學生物化學碩士學位;
2004年,獲美國大學洛克菲勒大學生物信息學博士學位,同年在洛克菲勒大學從事博士後研究;
2004年,加入中國科學院遺傳與發育生物學研究所,從此成為中國最年輕的博士生導師。
2004年6月獲洛克菲勒大學 (The Rockefeller University) 生物信息學方向博士學位, 同年在洛克菲勒大學從事博士後研究。
2005年1月加入中國科學院遺傳與發育生物學研究所。
2012年獲得“中央國家機關五四青年獎章標兵”榮譽稱號。
2013年獲得“中國青年五四獎章”,應邀在京參加了“實現中國夢、青春勇擔當”主題團日活動。在中共中央總書記、國家主席、中央軍委主席習近平等中央領導同志與各界優秀青年代表的座談會上,王秀傑研究員結合自身科研工作和個人成長經歷,做了專門發言。
研究領域
王秀傑博士領導的創新研究組的主要研究方向是生物信息學和系統生物學。我們將發揮計算機在處理大規模生物學數據上的優勢, 運用現代生物信息學技術, 對公共資料庫中的各種生物數據進行系統分析, 來發現新的基因和基因表達調控機制,構建遺傳網路調控模型,從巨觀上闡釋生命調控的規律。
主要研究內容包括:
1.真核生物中非編碼RNA的發現和功能研究。
利用新一代的高通量測序方法和生物信息學分析方法,對真核生物不同生長時期和生長條件下表達的小分子非編碼RNA進行系統地發現和功能研究。
2.轉錄組數據分析和新基因預測。
從cDNA、EST、基因晶片及全基因組小分子RNA表達譜等轉錄組數據中,發現新的編碼及非編碼基因,挖掘基因表達規律和基因間的表達調控關係,構建基因表達調控網路模型。
3.生物信息學算法和軟體的開發。
4.幹細胞多能性相關非編碼RNA功能研究
成就榮譽
2004年,受聘於中國科學院遺傳與發育生物學研究所,任課題組組長,研究員,博士生導師,成為中國最年輕的博士生導師。
2005年,入選中科院“百人計畫”項目。
2006年獲得了國家自然科學基金委創新群體基金的資助。
2007年獲得國家傑出青年科學基金和美國杜邦公司青年科學家獎。
2012年獲得“中央國家機關五四青年獎章標兵”榮譽稱號。
2013年獲得“中國青年五四獎章”,並在在中共中央總書記、國家主席、中央軍委主席習近平等中央領導同志與各界優秀青年代表的座談會上,做了專門發言。
開發軟體
GOEAST (Gene Ontology Enrichment Analysis Software Toolkit)
基因本體富集分析軟體工具箱,2008年發在《Nucleic Acids Res》(核酸研究)雜誌上 。截止2013年6月,Google scholar統計引用218次,網站軟體日使用40次以上。
psRobot (Plant Small RNA Analysis Toolbox)
植物小分子RNA分析工具,要分為兩個功能模組,第一個功能模組提供與小分子RNA本身相關的信息,包括小分子RNA在參考基因組上的定位以及莖環結構的位置、在不同小分子RNA合成蛋白突變體或AGO結合實驗中的表達水平等。用戶可以基於上述分析結果來判斷小分子RNA的產生與作用過程。第二個功能模組進行小分子RNA的靶基因預測,提供包括參考序列庫中的所有靶基因位點列表、靶位點的多重性、靶位點的保守性以及降解組數據等生物實驗數據信息 。
1.GOEAST (Gene Ontology Enrichment Analysis Software Toolkit)
基因本體富集分析軟體工具箱,2008年發在《Nucleic Acids Res》(核酸研究)雜誌上 。截止2013年6月,Google scholar統計引用218次,網站軟體日使用40次以上。
2.psRobot (Plant Small RNA Analysis Toolbox)
植物小分子RNA分析工具,要分為兩個功能模組,第一個功能模組提供與小分子RNA本身相關的信息,包括小分子RNA在參考基因組上的定位以及莖環結構的位置、在不同小分子RNA合成蛋白突變體或AGO結合實驗中的表達水平等。用戶可以基於上述分析結果來判斷小分子RNA的產生與作用過程。第二個功能模組進行小分子RNA的靶基因預測,提供包括參考序列庫中的所有靶基因位點列表、靶位點的多重性、靶位點的保守性以及降解組數據等生物實驗數據信息 。
發表文章
截止2013年6月10日,Google scholar檢索顯示,己發表論文(包括合作論文)共80篇,引用2841次,引用大於10次的文章39篇。具體文章列表可訪問遺傳發育所研究隊伍成員介紹或用Google school/Web of Knowledge聯合檢索作者姓名及單位。
近三年部分優秀文章推薦
Wu HJ, Wang ZM, Wang M andWang XJ*. (2013) Wide-spread long non-coding RNAs (lncRNAs) as endogenous target mimics (eTMs) for microRNAs in plants.Plant Physiology161:1875-84.2.
Ling HQ, Zhao S, Liu D, Wang J, Sun H, Zhang C, Fan H, Li D, Dong L, Tao Y, Gao C, Wu H, Li Y, Cui Y, Guo X, Zheng S, Wang B, Yu K, Liang Q, Yang W, Lou X, Chen J, Feng M, Jian J, Zhang X, Luo G, Jiang Y, Liu J, Wang Z, Sha Y, Zhang B, Wu H, Tang D, Shen Q, Xue P, Zou S,Wang X, Liu X, Wang F, Yang Y, An X, Dong Z, Zhang K, Zhang X, Luo MC, Dvorak J, Tong Y, Wang J, Yang H, Li Z, Wang D, Zhang A, Wang J. (2013) Draft genome of the wheat A-genomeTriticum urartu.Nature496:87-90.
Li RC, Tao J, Guo YB, WU HD, Liu RF, Bai Y, Lv ZZ, Luo GZ, Li LL, Wang M, Yang HQ, Gao W, Han QD, Zhang YY,Wang XJ, Xu M* and Wang SQ*. (2013) In vivo suppression of microRNA-24 prevents the transition toward decompensated hypertrophy in aortic-constricted mice.Circulation Research112: 601-605.
Zheng G, Dahl JA, Niu Y, Fedorcsak P, Huang CM, Li CJ, Vagbo CB, Shi Y, Wang WL, Song SH, Lu Z, Bosmans RP, Dai Q, Hao YJ, Yang X, Zhao WM, Tong WM,Wang XJ, Bogdan F, Furu K, Fu Y, Jia G, Zhao X, Liu J, Krokan HE, Klungland A, Yang YG* and He C*. ALKBH5 is a mammalian RNA demethylase that impacts RNA metabolism and mouse fertility.Molecular Cell10: 18-29.
Li W, Shuai L, Wan H, Dong M, Wang M, Sang L, Feng C, Luo GZ, Li T, Li X, Wang L, Zheng QY, Sheng C, Wu HJ, Liu Z, Liu L, Wang L,Wang XJ, Zhao XY* and Zhou Q*. (2012) Androgenetic haploid embryonic stem cells produce live transgenic mice.Nature490:407-411.
Xu M, Wu HD, Li RC, Zhang HB, Wang M, Tao J, Feng XH, Guo YB, Li SF, Lai ST, Zhou P, Li LL, Yang HQ, Luo GZ, Bai Y,Xi J, Gao W, Han QD, Zhang YY,Wang XJ*, Meng X and Wang SQ*. (2012) Mir-24 regulates Junctophilin-2 expression in cardiomyocytes.Circulation Research111:837-841. (*co-corresponding author)
Wu HJ, Zhang Z, Wang J, Oh DH, Dassanayake M, Liu B, Huang Q, Sun HX, Xia R, Wu Y, Wang Y, Yang Z, Liu Y, Zhang W, Zhang H, Chu J, Yan C, Fang S, Zhang J, Wang Y, Zhang F, Wang G, Lee SY, Cheeseman JM, Yang B, Li B, Ming J, Yang L, Wang J, Chu C*, Chen S*, Bohert HJ, Zhu JK*,Wang XJ*and Xie Q*. (2012) Insights into salt tolerance from the genome ofThellungislla salsuginea.Proc. Natl. Acad. Sci. USA109: 12219-12224. (*co-corresponding author)
Wu HJ, Ma YK, Chen T, Wang M andWang XJ*. (2012) PsRobot: a web-based plant small RNA meta-analysis toolbox.Nucleic Acids Research40:W22-W28.
Zhao YT, Wang M, Fu SX, Yang WC, Qi CK andWang XJ*. (2012) Small RNA profiling in twoBrassica napuscultivars identifies microRNAs with oil production and developmental correlated expressions and new small RNA classes.Plant Physiology158:813-823.
Sheng C, Zheng QY, Wu JY, Xu Z, Wang LB, Li W, Zhang HJ, Zhao XY, Liu L, Wang ZW, Guo CL, Wu HJ, Liu ZH, Wang L, He SG,Wang XJ, Chen ZG and Zhou Q. (2012) Direct reprogramming of sertoli cells into multipotent neural stem cells by defiend factors.Cell Research22:208-218.
Wang H, Zhang X, Liu J, Kiba T, Woo J, Ojo T, Hafner M, Tuschl T, Chua NH* andWang XJ*.(2011) Deep sequencing of small RNAs specifically associated with Arabidopsis AGO1 and AGO4 uncovers new AGO functions.The Plant Journal67:292-304.
Li W, Zhao XY, Wan HF, Zhang Y, Liu L, Zhuo L,Wang XJ, Wang L and Zhou Q. (2011) iPS cells generated without c-Myc have activeDlk1-Dio3region and are capable of producing full-term mice through tetraploid complementation.Cell Research21:550-553.
Tong M, Lv Z, Liu L, Zhu H, Zheng QY, Zhao XY, Li W, Wu YB, Zhang HJ, Wu HJ, Li ZK, Zeng FY, Wang L,WangXJ, Sha JH and Zhou Q. (2011) Mice generated from tetraploid complementation competent iPS cells show similar developmental features as those from ES cells but are prone to tumorigenesis.Cell Research21: 1634-1637.
1.Wang XJ*
2.Wang X
3.Wang XJ
4.Wang XJ
5.Wang XJ
6.Wang XJ
7.Wang XJ*
8.Wang XJ*
9.Wang XJ*
10.Wang XJ
11.Wang XJ*.
12.Wang XJ
13.WangXJ
新聞報導
2004-10-28 北京晨報、廣州日報、搜狐新聞 27歲女博士當上中科院博導
2007-09-18 綏化新聞網 中國最年輕的博導
2011-12-07 中青線上 我的青春故事--王秀傑
2012-05-04 搜狐新聞 遺傳發育所王秀傑榮獲“中央國家機關青年五四獎章標兵”
2013-05-05 中國科學院 王秀傑研究員榮獲“中國青年五四獎章”