辦公室職責:負責全站黨政工作的組織協調,檔案、文秘的處理分發工作,負責財務管理、後勤、安全、防火、保密、計畫生育等行政事務管理工作。
技術綜合室:負責全市環境質量監測數據的統計、分析、匯總、存檔和上報,負責編寫《牡丹江市環境監測年鑑》、《環境質量報告書》、《牡丹江市重點工業污染源污染狀況報告書》。
質量控制室:負責國家《環境監測技術規範》的組織實施工作;負責環保產品的質量監督、檢測,排污申報的技術評審;負責全市環境監測網路的建設和指導工作。
大氣監測室:負責對大氣環境質量的經常性監測和分析、評價;對大氣污染源的監視性監測和大氣污染防治設施驗收監測;降塵、降雨的經常性監測;負責大氣污染糾紛、污染事故的信訪工作。
水質監測室:負責對全市地面水、地下水水質的經常性監測和分析、評價;負責對飲用水源地水質的監督性監測;負責水治理防治設施驗收監測;負責水污染糾紛、污染事故的信訪工作。
生物監測室:負責全市地面水中大腸菌群、細菌總數、浮遊動植物等控制因子的監測;負責環境質量生物學評價;負責農藥、化肥殘留量測試和生物體殘毒分析;負責魚類等水生動植物監測;負責醫療廢水防治工程驗收監測。
物理監測室:負責市區交通噪聲、工業噪聲、建築施工噪聲、社會生活噪聲監測;負責噪聲功能區及區域環境噪聲監測和評價工作;負責機動車尾氣監測;負責
噪聲污染防治工程驗收監測;負責噪聲污染糾紛和事故的信訪工作。
監察監測室:負責排污收費監測;負責污染防治設施監督監測;負責緊急事故監測;負責許可證制度監測及日常監測。
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