生物特性
在麥芽汁瓊脂培養基上，其菌落蔓延生長，可成氈狀，有氣生菌絲。菌絲體初呈白色，逐漸變為灰黑色。菌落背面為紅褐色。菌絲分隔，分枝，多核，含有油滴和淡褐色顆粒，直徑2～7μm。分生孢子單生或成鏈，球形或梨形，直徑4.5～11μm。閉囊殼(被子器)褐色，球形，直徑30～50μm。子囊為球形，內含8個子囊孢子，成熟後，子囊壁即消失。於是看不到子囊，只能看到閉囊殼(或被子器)。
子囊孢子卵圓形、光滑、褐色，大小為(4.5～6)μm×(3.5～5)μm。
此菌能發酵纖維二糖、蔗糖、果糖、山梨醇、d一阿拉伯糖等，然後產生酸類。
繁殖方式
無性繁殖
煙色紅麴黴菌絲的每個細胞都含有多核。菌絲體常有聯結現象。它們在進行無性繁殖時，在菌絲或其分枝的頂端直接產生分生孢子，分生孢子單生或二至數個成鏈，一般為梨形，內含多核。分生孢子萌發後即形成菌絲，這是無性循環。
有性繁殖
有性繁殖是在茵絲頂端或側枝頂端首先形成一個多核的單細胞雄器，隨後在雄器下面的細胞又以單軸方式生出～個細胞，這個細胞就是原始的雌性器官，也即產囊器的前身。由於雌性器官的生長和發育將雄器向下推壓，而使雄器與柄托呈一定角度。這時雌性器官在頂部又產生一層隔膜，分成兩個細胞，頂端的細胞為受精絲，另一個細胞即產囊器，二者都含有幾個細胞核。當受精絲尖端與雄器接觸後，接觸點的細胞壁解體產生一孔。雄器內的細胞質和核通過受精絲而進入產囊器內。此時只進行質配，而細胞核則成對排列，並不結合。與此同時，在兩性器官下面生出許多菌絲將其包圍，形成初期的閉囊殼。殼內的產囊器膨大，並長出許多產囊絲。每個產囊絲形成許多雙核細胞，核配子此時發生。經過核配的細胞即子囊母細胞。每個子囊母細胞中的核經三次分裂，形成8個核，每個核發育成一個單核的子囊孢子。子囊母細胞即變成子囊。故每個子囊都含有8個卵形的子囊孢子。這時閉囊殼已發育成熟，其中子囊壁消解，子囊孢子成堆的留在殼內。當閉囊殼破裂後，散出子囊孢子。子囊孢予蔭發後又成為多核菌絲。
煙色紅麴黴生活史實際套用
紅麴黴用途很多，我國早在明朝就用它們來培制紅曲。紅曲可作中藥，消食活血，健脾燥胃。
紅曲亦可作為食品染色劑和調味劑。
我國東南各省，用紅曲釀製紅酒，俗稱老酒，聞名於世。紅曲還能制醋，例如，福建平湖曲醋，素馳名。
