醫院前身為國家信息產業部直屬醫院,創辦於1959年2月,先後稱為電子總醫院、401醫院、北京酒仙橋醫院。1994年被北京市衛生局評定為三級醫院和愛嬰醫院,1995年起被北京市列為大病統籌定點醫院、公費醫療定點醫院和首批醫保定點醫院。2003年4月劃歸國家教育部成為清華大學附屬醫院。醫院多年被評為“首都公共衛生文明單位”。
醫院學科齊全、人才薈萃,設有心臟、泌尿、消化三個專科,其他臨床醫療醫技科室38個、研究所2個。其中,著名心外科專家吳清玉教授帶領的心臟外科在採用多種創新技術治療先天性心臟病、冠心病、心臟瓣膜病、夾層動脈瘤等疾病,特別在治療疑難、危重和複雜心臟畸形方面處於國際先進水平,具有廣泛的影響力。兒科在新生兒窒息、缺氧缺血性腦病診治方面享有盛譽。全院在職職工1100餘人,其中醫務人員800餘人。正教授、主任醫師等高級職稱專家40多名(含博士生導師3名、享受政府特殊津貼專家20多名),副教授、副主任醫師等副高職稱專家110多名。
醫院設施完善、設備先進,醫療儀器設備總值近2億元,擁有國內第一台西門子雙C臂血管造影系統、飛利浦Achieva 1.5T磁共振檢查儀, IE33、ViVid7等一大批國內外先進水平的醫療設備。
醫院位於緊鄰東四環的北京市朝陽區酒仙橋地區,緊鄰四環路和機場高速路,交通方便。占地面積5.2萬平方米,建築面積4.3萬平方米,年門急診50餘萬人次,住院患者1萬多人次。建築面積2.7萬平方米的11層新病房大樓已投入使用,開放病床559張。
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