歷史沿革
套用技術學院
軟體學院的前身是套用技術學院。套用技術學院成立於1999年9月，簡稱技術學院，學制2年，開展以第二學士學位為主的高層次職業技術教育。學院教工由核能技術設計研究院和國家CAD支撐軟體工程中心抽調的部分人員兼職組成，時任清華大學教務長吳敏生教授兼任套用技術學院院長。創辦之初設立計算機軟體工程專業，招生對象為已獲普通高校學士學位的本科畢業生， 2000年增加（微電子）第二學位專業。
軟體學院建立
2001年，為適應我國經濟結構戰略性調整的要求和軟體產業發展對人才的迫切需要，加大高等教育人才培養結構調整力度，推進高校辦學體制改革，教育部和國家發展計畫委員會共同研究決定選擇部分高等學校，採用多項扶持政策，支持其試辦示範性軟體學院。
清華大學作為首批獲準試辦示範性軟體學院的高等院校，2001年12月24日經2001-2002學年度第6次校務會議討論通過成立軟體學院（英文名稱：School of Software），為實體學院，組織上隸屬清華大學信息科學與技術學院。時任清華大學副校長顧秉林院士兼任軟體學院院長，時國家CAD支撐軟體工程技術研究中心主任孫家廣院士任軟體學院常務副院長。同時國家CAD支撐軟體工程技術研究中心隨即掛靠軟體學院，套用技術學院與軟體學院合併，套用技術學院兼職教工編制全部轉到軟體學院，計算機軟體工程第二學位專業學生學籍轉為軟體學院，微電子第二學位專業學籍保留在套用技術學院。
2006年7月最後一批微電子專業第二學位學生畢業，套用技術學院不再承擔學位教育工作，工作重心轉為非學歷社會培訓。2008年7月6日，根據清校發【2008】48號通知，撤銷套用技術學院建制。
昌平校區
軟體學院分清華園校區和昌平校區兩部分，設計算機軟體本科專業、計算機軟體工程第二學位和軟體工程領域軟體工程碩士學科，同時承擔部分學籍在計算機系的計算機科學與技術工學碩士與博士培養工作及博士後合作研究工作。清華園校區主體坐落於清華大學西北角原廂白小營小區，部分行政機構位於清華大學中央主樓8層，使用面積約3800平方米，以培養本科生和工程碩士研究生為主。
昌平校區為原套用技術學院所在地，以培養二學位學生為主。2004年7月二學位停召，軟體學院昌平校區設備全部搬回清華園校區，昌平校區隨之取消。
科研團隊
學院以建設一支高水平國際化教師隊伍為師資隊伍建設目標，強調激勵與約束並重、量化考核與注重實績結合，實行分類管理，追求人盡其才，注重團隊建設，形成了良性的人才培養與流動機制。目前學院共有教工39名，其中1名北京市高等學校教學名師，2北京市教育創新標兵，1名北京市師德先進個人，1名北京高校優秀輔導員，2名教師獲“國家傑出青年基金”，2名教師獲教育部“新世紀優秀人才支持計畫”，多名清華大學良師益友和1名“清韻燭光——我最喜愛的教師”。2009年學院設立了《軟體理論》講席教授組，2007年圖靈獎獲得者Joseph Sifakis教授擔任首席，其餘團組成員10人均由海外知名專家學者組成。另外，學院聘請客座教授1人，兼職教授1人，訪問教授5人，其中中國工程院院士1人。創辦國家示範性軟體學院的發起者、國務院學位委員會委員、國務院學位委員會計算機科學與技術學科評議組成員、教育部計算機科學與技術教指委副主任、軟體工程教指委主任、清華大學學術委員會副主任、清華大學信息學院院長、中國工程院院士孫家廣兼任學院院長。
師資概況
學院以建設一支高水平國際化教師隊伍為師資隊伍建設目標，強調激勵與約束並重、量化考核與注重實績結合，實行分類管理，追求人盡其才，注重團隊建設，形成了良性的人才培養與流動機制。目前學院共有教工39名，其中1名北京市高等學校教學名師，2北京市教育創新標兵，1名北京市師德先進個人，1名北京高校優秀輔導員，4名教師獲“國家傑出青年基金”，2名教師獲教育部“新世紀優秀人才支持計畫”，多名清華大學良師益友和1名“清韻燭光——我最喜愛的教師”。2009年學院設立了《軟體理論》講席教授組，2007年圖靈獎獲得者Joseph Sifakis教授擔任首席，其餘團組成員10人均由海外知名專家學者組成。另外，學院聘請客座教授3人，兼職教授1人，訪問教授5人，其中中國工程院院士1人。創辦國家示範性軟體學院的發起者、國務院學位委員會委員、國務院學位委員會計算機科學與技術學科評議組成員、教育部計算機科學與技術教指委副主任、軟體工程教指委主任、清華大學學術委員會副主任、清華大學信息學院院長、中國工程院院士孫家廣兼任學院院長。
教學成果
清華大學軟體學院“清華大學軟體學院人才培養模式的探索與實踐”和“軟體創新人才培養的課程體系與實驗平台建設”分別獲2006年、2008年清華大學教學成果一等獎，“清華大學軟體拔尖創新人才培養實驗區”入選2008年度教育部人才培養模式創新實驗區。學院設有計算機軟體本科專業和軟體工程碩士學位教育，以培養具有良好的綜合素質、良好的職業道德、紮實的軟體理論和軟體工程專業基礎知識，具有良好的軟體設計與實現能力、良好的項目管理能力、良好的交流與組織協調能力、較強的參與國際競爭能力和創新能力的計算機軟體人才為目標，全力探索優秀軟體人才的培養模式。先後確定了“案例教學”、“課程大作業”、“專業專題實踐”、“強化英語訓練”等實踐教學策略和“教授備課制”、“論文盲評制”、“博士生開題四段制”等教學管理策略；同時為培養學生的創新創業意識、團隊協作能力和綜合職業素養，學院還設立軟體學院科學研究獎學金項目（SSRT），主辦清華大學軟體設計大賽，與國內外知名軟體企業聯合舉辦軟體創新人才高級訓練營，鼓勵學生參與國內外各類相關領域賽事，每年拿出10萬餘元支持學生的科學研究與實踐項目。不僅如此，學院的科研平台也為學生提供了良好的參與科研活動的環境。現有在校學生889人，其中本科生251人，軟體工程碩士541人，工學碩士45人，博士生52人。
國際交流
學院的學科發展以國家重大戰略需求和國際科技前沿為導向，以計算機科學與技術、信息安全、系統科學、計算數學和套用數學等為依託，注重跨一級學科的交叉與聯合。學院在深入研究和分析ACM/IEEE CC2005的基礎上，開展軟體工程課程體系研究，結合我國軟體工程專業的發展要求，編寫出版了《中國軟體工程學科教程》，組織研製了我國高等教育軟體工程專業規範。2007年學院軟體工程與管理、信息系統安全、軟體系統設計、計算機圖形學、信息系統工程等5個專業方向入選教育部高等學校特色專業建設點。學院現有2門國家級精品課程，4門校級精品課，主編的2部教材被評為普通高等教育精品教材，7部教材入選“十一五”國家規劃教材。
科研工作
科研工作是軟體學院工作的重要組成部分。軟體學院擁有一個國家級工程中心——國家企業信息化套用支撐軟體工程技術研究中心和一個教育部重點實驗室——信息系統安全實驗室（籌）作為其科研工作的支撐平台，同時還組建了四個研究所，分別在軟體理論系統、信息組織與管理、軟體工程、計算機圖形學和計算機輔助設計、信息系統安全等領域從事教學科研工作。學院強調教研相長，注重科研成果轉化為現實生產力，服務社會，初步形成了良性的科研管理機制，形成了良好的產學研格局。學院先後承擔了七十餘項國家自然科學基金、973計畫、863計畫、國家十五科技攻關、科技支撐計畫、國家重點行業和企業信息化工程等國家級科研項目和國際合作項目，研究出十餘項擁有自主智慧財產權的軟體產品，獲得國家數十項獎勵，包括國家科技進步二等獎、國家九五科技攻關重大成果獎、中國軟體行業協會優秀軟體獎、863目標產品評測第一名等。
作為國家示範性軟體學院，清華大學軟體學院秉承清華大學“自強不息、厚德載物”的校訓，積極推行我國軟體人才培養的改革和創新，努力將學院建設成國際一流水平的學院。
教學概況
軟體學院推行高層次、實用型、複合式的工程科學技術教育，強調人才培養的實用性和專業性，培養具有良好的綜合素質、良好的職業道德、紮實的軟體理論和軟體工程專業基礎知識，並且具有良好的軟體設計與實現能力、良好的項目管理能力、良好的交流與組織協調能力、較強的參與國際競爭能力和創新能力的計算機軟體專業人才，學生畢業後能夠從事計算機軟體領域的科學研究、技術開發、教學及管理等工作。
學院現有教師30人，其中教授9人（博士生導師8人），副教授14人，具有博士學位的青年教師27人。學院還聘請國內外知名教授和軟體專家作為學院的兼職教授，現聘任兼職教授共4人，其中中國工程院院士3人，長江特聘教授1人。軟體學院正在逐步形成學術造詣深，教學水平和軟體開發經驗豐富的教師隊伍。
軟體學院現有四類學生：計算機軟體專業本科、軟體工程碩士（MSE）、軟體工學碩士、軟體與理論工學博士，全方位滿足社會各界人士學習計算機軟體專業的需求。目前，學院設有大學本科教育以及軟體工程碩士（MSE）教育。學院現有在校學生889人，其中本科生251人，MSE（軟體工程碩士）541人，工學碩士生45人，博士生52人。學院現開設本科生和研究生課程60餘多門，在課程設定和教學大綱中突出數學基礎、強調外語能力、注重編程訓練、拓寬素質教育、反映軟體界最新成果。
清華大學軟體學院的學科發展以計算機科學與技術、計算數學和套用數學等為依託，注重跨一級學科的交叉與聯合。學院成立了軟體理論與系統、軟體工程與管理、信息系統與工程、圖像處理與圖形學等四個研究所，並在此基礎上開設了六十餘門專業課，其中50%以上的課程與最新軟體技術相結合，有些課程還與國外大學和知名企業合作，使學生不僅有紮實的理論基礎，還能掌握國際最新前沿技術。
學院具備良好的教學實驗環境，為學生每人配備一台高檔微機，使其在學習理論基礎的同時，獲得大量的軟體開發訓練和實踐機會。此外，結合專業課程教學，開展多種軟體技術認證培訓，使學生在工程素質、專業技能和獨立工作能力等方面獲得良好的訓練。
作為教育部示範性軟體學院，清華大學軟體學院努力與國際接軌，按照國際軟體標準辦學，積極推行我國軟體人才培養的改革和創新，堅持質量第一、素質與技術並重、理論與實踐結合，爭取將學院建設成國際一流水平。
畢業去向
01-09年研究生畢業去向前50名
| 去向 | 人數 | 比例 | |
| 1 | 用友軟體 | 34 | 2.07% |
| 2 | 美國 | 29 | 1.76% |
| 3 | IBM | 26 | 1.58% |
| 4 | 清華大學 | 23 | 1.40% |
| 5 | 工商銀行 | 22 | 1.34% |
| 5 | 聯想 | 22 | 1.34% |
| 5 | 中國移動 | 22 | 1.34% |
| 8 | 微軟 | 20 | 1.22% |
| 8 | 中軟國際 | 20 | 1.22% |
| 10 | 農業銀行 | 18 | 1.09% |
| 10 | 清華同方 | 18 | 1.09% |
| 10 | 清華紫光 | 18 | 1.09% |
| 10 | 斯倫貝謝公司 | 18 | 1.09% |
| 14 | 清華英泰 | 17 | 1.03% |
| 15 | 中國銀行 | 16 | 0.97% |
| 16 | 中國電信 | 12 | 0.73% |
| 16 | 中訊軟體集團 | 12 | 0.73% |
| 16 | 自主創業 | 12 | 0.73% |
| 19 | 科泰世紀科技 | 11 | 0.67% |
| 20 | 凌怡科技公司 | 9 | 0.55% |
| 20 | 亞信科技 | 9 | 0.55% |
| 20 | 中科軟體 | 9 | 0.55% |
| 23 | 人壽保險 | 8 | 0.49% |
| 23 | 中國電子科技集團 | 8 | 0.49% |
| 23 | 中信銀行 | 8 | 0.49% |
| 26 | 朗訊科技 | 7 | 0.43% |
| 26 | 聯通 | 7 | 0.43% |
| 26 | 日本 | 7 | 0.43% |
| 26 | 神州數碼 | 7 | 0.43% |
| 26 | 網通集團通信公司 | 7 | 0.43% |
| 31 | 百度線上網路技術 | 6 | 0.36% |
| 31 | 北大方正 | 6 | 0.36% |
| 31 | 大唐電信 | 6 | 0.36% |
| 31 | 航空結算中心 | 6 | 0.36% |
| 31 | 群碩軟體開發（上海） | 6 | 0.36% |
| 31 | 日立 | 6 | 0.36% |
| 31 | 完美時空網路技術 | 6 | 0.36% |
| 31 | 長城軟體 | 6 | 0.36% |
| 39 | 安永華明會計師事務所 | 5 | 0.30% |
| 39 | 北京大學 | 5 | 0.30% |
| 39 | 航天信息 | 5 | 0.30% |
| 39 | 惠普 | 5 | 0.30% |
| 39 | 建築科學研究院 | 5 | 0.30% |
| 39 | 金蝶軟體 | 5 | 0.30% |
| 39 | 民航信息網路 | 5 | 0.30% |
| 39 | 麒麟遠創 | 5 | 0.30% |
| 39 | 首都電信 | 5 | 0.30% |
| 39 | 搜狐 | 5 | 0.30% |
| 39 | 億科三友科技 | 5 | 0.30% |
| 39 | 億陽信通 | 5 | 0.30% |
| 39 | 奕恆佳源軟體公司 | 5 | 0.30% |
01-05級本科生畢業去向
| 去向 | 人數 | 比例 | |
| 1 | 清華工學碩士 | 83 | 35.17% |
| 2 | 美國 | 39 | 16.53% |
| 3 | 清華軟體工程碩士 | 25 | 10.59% |
| 4 | 清華工學博士 | 6 | 2.54% |
| 4 | 中科院工學碩士 | 6 | 2.54% |
| 6 | 待業 | 5 | 2.12% |
| 7 | 專科畢業 | 3 | 1.27% |
| 7 | 自主創業 | 3 | 1.27% |
| 9 | 百度 | 2 | 0.85% |
| 9 | 復旦大學碩士 | 2 | 0.85% |
| 9 | 國雙科技 | 2 | 0.85% |
| 9 | 斯侖貝謝 | 2 | 0.85% |
| 9 | 香港 | 2 | 0.85% |
| 9 | 香港大學碩士 | 2 | 0.85% |
| 9 | 留級 | 2 | 0.85% |
| 9 | 用友軟體 | 2 | 0.85% |
| 9 | 中山大學碩士 | 2 | 0.85% |
| 18 | 微軟 | 1 | 0.42% |
| 18 | 奧浦諾管理諮詢 | 1 | 0.42% |
| 18 | 澳大利亞 | 1 | 0.42% |
| 18 | 北京外企服務集團 | 1 | 0.42% |
| 18 | 北理工軟體學院研究生 | 1 | 0.42% |
| 18 | 博科信息產業 | 1 | 0.42% |
| 18 | 德國 | 1 | 0.42% |
| 18 | 鼎輝投資 | 1 | 0.42% |
| 18 | 東方口岸科技 | 1 | 0.42% |
| 18 | 法國 | 1 | 0.42% |
| 18 | 高盛 | 1 | 0.42% |
| 18 | 工商銀行 | 1 | 0.42% |
| 18 | 供電實業 | 1 | 0.42% |
| 18 | 廣發證券 | 1 | 0.42% |
| 18 | 廣聯達慧中 | 1 | 0.42% |
| 18 | 廣州市信息化中心 | 1 | 0.42% |
| 18 | 國務院港澳辦公室 | 1 | 0.42% |
| 18 | 海雲天 | 1 | 0.42% |
| 18 | 漢略信息技術 | 1 | 0.42% |
| 18 | 航天信息 | 1 | 0.42% |
| 18 | 惠普 | 1 | 0.42% |
| 18 | 加拿大 | 1 | 0.42% |
| 18 | 建設銀行 | 1 | 0.42% |
| 18 | 麒麟遠創 | 1 | 0.42% |
| 18 | 清華法律碩士 | 1 | 0.42% |
| 18 | 清華萬博網路技術 | 1 | 0.42% |
| 18 | 清華醫學院生物工程碩士 | 1 | 0.42% |
| 18 | 賽迪時代 | 1 | 0.42% |
| 18 | 上海國泰人壽保險公司 | 1 | 0.42% |
| 18 | 上海中軟資源技術服務 | 1 | 0.42% |
| 18 | 深圳發展銀行 | 1 | 0.42% |
| 18 | 首都開發 | 1 | 0.42% |
| 18 | 數碼視訊科技 | 1 | 0.42% |
| 18 | 搜狐 | 1 | 0.42% |
| 18 | 騰訊 | 1 | 0.42% |
| 18 | 五湖四海人力資源 | 1 | 0.42% |
| 18 | 西昌衛星測控中心 | 1 | 0.42% |
| 18 | 清華信研院碩士 | 1 | 0.42% |
| 18 | 長沙長城醫療信息技術 | 1 | 0.42% |
| 18 | 智樂軟體 | 1 | 0.42% |
| 18 | 中國建築裝飾工程公司 | 1 | 0.42% |
| 18 | 中國民航信息網路 | 1 | 0.42% |
| 18 | 中國農業銀行 | 1 | 0.42% |
| 18 | 中國專利信息中心 | 1 | 0.42% |
| 18 | 中航世新燃氣輪機 | 1 | 0.42% |
| 18 | 中牧實業 | 1 | 0.42% |
| 18 | 重慶市委組織部 | 1 | 0.42% |
| 18 | 重慶銀行 | 1 | 0.42% |
存在的問題
存在的問題：與國內好多高校一樣，軟體學院受到計算機系的歧視。但是鄙人不知道這種歧視有何而來，從何而生。本是同根生，相煎何太急！
雖然錄取分數上看，軟體學院的分數線是要比計算機的低，但軟體工程更注重動手能力的培養，相對而言軟體工程專業畢業的學生更適合就業或者更好找工作，當然計算機的就業面更廣一點。
