規模
醫院現有病床900張，工作人員980餘人，其中副高以上職稱161人、碩士以上研究生49人。年門診量45萬人次，出院病人2萬1千餘人次。全院設有41個臨床專業科室和醫技科室，有病區27個以及I
CU、CCU、RICU監護病房。下設3個分院和2個門診部，形成了以總院為中心、多點分布的醫療服務網路體系。
戰略
近年來，醫院積極實施“科教興院”戰略，堅持“短、平、快”項目與“高、精、尖”項目協調發展，突出“人有專長、科有特色、院有重點”的技術發展方向，從技術、人才、管理三方面入手，狠抓醫療質量，加強內涵建設，努力打造放心醫院、平安醫院，受到了患者的認可。先進設備
目前醫院擁有大C臂、螺鏇CT、全身彩色都卜勒、菲利浦1000毫安X光機、腫瘤射頻熱療機、美國480型及AK-100型人工腎機、德國西門子多功能心電監護儀、人工心肺機、體外震波碎石機、高壓氧艙、多台腹腔鏡、系列電子內窺鏡、肌電圖、全自動生化分析儀、DSA等萬元以上先進大型醫療儀器設備350餘台（件），促進了醫療質量和技術水平的提高。在科技興院戰略的帶動下，醫院堅持以病人為中心，以質量為核心，醫療技術水平有了很大提高。近年來，依靠自身力量先後開展了心臟移植術、腎臟移植術、肝臟移植術、心臟冠狀動脈搭橋術、冠狀動脈造影、支架安裝、射頻消融等一系列新技術、新項目，為廣大患者帶來了福音。目前，醫療範圍輻射至宿遷、徐州、鹽城、連雲港、揚州等地區以及安徽、山東等省市。普外科、消化內科、心內科、呼吸科、老年科、眼科為淮安市重點專科。心胸外科、腫瘤外科、神經內科、乳腺普查中心、介入放射中心、準分子雷射近視眼治療中心、血液透析中心、骨科、婦產科、血液科等一大批臨床科室有較高的社會信譽。尤其是微創技術、介入放射、心臟介入、手足外科等，在淮安市均處於領先水平。近年來，醫院先後獲得市級以上科技進步獎100餘項，在省級以上刊物發表論文1200餘篇。
醫院幾十年來始終堅持“全心全意為病員服務”的宗旨，重視和加強文化建設，培養了鮮明的具有個性特徵的醫院精神。多年來，病員綜合滿意度始終保持在90%以上，醫療質量指標一直位居全省前列，而醫療費用指標位居全省最低。由於注重社會效益，設身處地為廣大民眾著想，醫院取得了良好的社會信譽。1985年以來，醫院連續16年被評為省級“文明單位”；兩次榮獲衛生部“全國衛生文明先進集體”；2001-2003年，醫院連續三年被評為全國首批“百姓放心醫院”；2004年被評為全國首批“百姓放心示範醫院”；2006年在江蘇省萬人評議醫療機構活動中被評為“最佳滿意綜合性醫院”。
細胞生物中心
淮安市第二人民醫院細胞生物治療中心是集醫療、教學、科研、康復為一體的醫院重點建設學科，位於醫院內科樓15層，中心邀請享有盛名的國內外生物學家及淮安市第二人民醫院海外歸來博士、博士後、專家教授等高科技專業人才組成 一支強大的科研團隊，並斥巨資引進德國、美國、日本的流式細胞儀、血細胞分離機、培養箱、離心機、血細胞分析儀、超純淨水儀、倒置螢光顯微鏡、CCD成像系統等檢測設備。中心擁有CMP達標的精華實驗室、無菌層流室、細胞製備間、PCR實驗室等，可從事細胞冷凍、細胞分離、細胞培養、免疫檢測等相關的臨床及實驗室技術；開展幹細胞與再生醫學、實驗血液學、分在生物學、基因藥物等多個專業項目。
細胞生物治療中心是江蘇省內首家幹細胞與生物創新醫學臨床轉化基地，也是江蘇省首家可在一小時內提供細胞製品的標準化生產套用研究中心，更是國內僅有幾家擁有標準化製備實驗室，細胞移植與生物治療室以及舒適住院條件的高規格細胞生物治療中心。
