決戰、第三新東京市

受到加粒子炮攻擊的初號機，所幸未傷至要害，但真嗣卻對戰鬥開始膽怯。另一方，使徒正在使用能量鑽向NERV總部的位置展開攻擊。面對持有自動防禦系統的使徒，美里提出了超遠距離射擊的提案，並取名為“屋島作戰”。數小時後，日本列島全土的能源，集束於戰自（日本戰略自衛隊）的正電子炮內，狙擊手為真嗣，麗駕駛零號機執行防禦任務。於是，使徒加粒子炮與正電子炮的兩束熱能交錯飛過，使徒被擊墜，而麗擋在了真嗣的面前。

總介

原名“決戦、第3新東京市”，1995年11月8日初映。
腳本：薩川昭夫、庵野秀明
設計：摩砂雪
演出：石堂宏之作畫監督：細井信宏

決戰、第三新東京市

解說

這一話基本圍繞對第五使徒的攻防戰展開。此外，美里對作戰計畫的命名很有趣。原日文地名翻譯過來有四個意思，“八島、矢島、屋島、八嶼”都可以。EVA中此戰又名“二子山之戰”（作戰地點就在和屋島相距不遠的二子山）。同時，在日本古代戰例中的屋島合戰里，有一個“那須與一從岸上一箭射落船上平氏的扇子”的典故與美里的“一點貫穿”作戰計畫形式相仿。另外，日本列島又素有“八島”的稱法，老庵為求此雙關還專門把此地名（屋島）改成了假名。故由日本全土收集來的集束化能源射擊及作戰地點屋島這兩個意義，決定了這個作戰計畫的名稱。綜合考慮後，字幕翻譯則定名“屋島作戰”。

當然，最後的場面中真嗣將麗從融化了的零號機里救出後，麗說：“對不起，這種時刻我不知道該用怎樣的表情面對你。”而真嗣的台詞“我想微笑就可以了”這段，在片中起到了相當好的平衡作用，是給人留下印象較深的部分。