歷史沿革
1951年，江西藥科學校成立（藥學院前身）；
1958年7月，經江西省人民委員會批准，更名為江西中醫專科學校；
江西中醫藥大學 校園風光1959年5月，經江西省人民委員會批准，江西中醫學院正式宣告成立；
1969年5月，江西中醫學院與江西醫學院合併為 江西醫科大學；
1973年3月，經國務院批准，江西省革命委員會同意在江西藥科學校基礎上恢復江西中醫學院，成立江西中醫學院藥學系；
1983年，獲碩士研究生招生資格；
2001年，分拆為藥學系和中藥系；
2007年，藥學系和中藥系兩系合併成立藥學院；
2013年4月，更名為”江西中醫藥大學藥學院“；
2013年8月，經國務院學位委員會第三十次會議審議批准，江西中醫藥大學被確定為博士學位授予單位，藥學院成為中藥學一級學科博士學位授權單位。
辦學規模
學科專業
藥學院現有博士學位授權一級學科1個（中藥學）、碩士學位授權一級學科點1個（中藥學），碩士學位授權二級學科點14個、本科專業10個。
1.博士生教育
| 學科門類 | 一級學科 | 二級學科 |
| 10 醫學 | 1008 中藥學 | 100801中藥資源開發與利用研究 |
| 100802 中藥藥性與配伍機制研究 | ||
| 100803中藥製劑與工程技術研究 | ||
| 100804中藥炮製與質量評價研究 |
2.碩士生教育
藥學院擁有2個一級學術型學科碩士點，8個二級學科碩士點。另外，學院還有2個專業型碩士點，即藥學碩士、中藥學碩士。
2.1學術型碩士研究生
| 學科門類 | 一級學科 | 二級學科 |
| 10 醫學 | 1007 藥學 | 100701藥物化學 |
| 100702藥劑學 | ||
| 100703生藥學 | ||
| 100704藥物分析學 | ||
| 100706藥理學 | ||
| 1008 中藥學 | 100800 中藥學 | |
| 1008Z2 臨床中藥學 | ||
| 1008Z9 藥事管理學 |
2.2專業型碩士研究生
| 學科門類 | 學科領域 |
| 10 醫學 | 105500藥學碩士 |
| 105600中藥學碩士 |
3.本科生教育
藥學院本科生開設專業涉及理學、工學兩大領域，具體如下：
| 學科門類 | 開設專業 | ||
| 07 理學學士 | 藥學 | 中藥學 | 中藥學（國際交流） |
| 中藥資源與開發 | 套用化學 | 環境科學 | |
| 08 工學學士 | 製藥工程 | 藥物製劑 | 中藥製藥 |
| 食品質量與安全 | |||
師資隊伍
教育大計，教師為本。藥學院大力實施人才強院戰略，堅持外引人才、內穩隊伍、注重培養的人才建設思路，著力打造一支師德高尚、業務精湛、結構合理、充滿活力的教師隊伍。
藥學院現有教職員工112人，具有副高以上職稱人員55人，其中，博士生導師18人，碩士生導師35人，省部級重點學科帶頭人9人，省級中青年骨幹教師14人，獲國務院特殊津貼專家5人，獲省政府特殊津貼專家2人，全國優秀教師2人，井岡學者1人，贛鄱英才555工程人選6人，江西省主要學科學術和技術帶頭人培養對象1人，江西省青年科學家3人。
學院還擁有國家級優秀教學團隊1個、省級優秀教學團隊1個，省級優秀科研團隊1個。
學科建設
中藥炮製室——惟仁堂藥學院堅持以學科建設為龍頭，採取系列有效措施，加強學科平台、學科團隊和重點學科建設，取得顯著成效。
藥學院現有國家中醫藥管理局重點學科5個、江西省高水平學科1個、江西省“十二五”重點學科1個、江西省示範性碩士點1個；現有國家中醫藥管理局中藥資源評價三級科研實驗室、江西省中藥種質資源工程技術研究中心、江西省中藥藥理重點實驗室、江西省傳統炮製現代研究重點實驗室、江西省樟幫飲片炮製工程技術研究中心等省部級科研平台5個。
藥學院還充分發揮中藥炮製學科優勢，加強中藥炮製傳統工藝實訓和中藥炮製傳統文化推廣，建設完成中藥炮製實訓平台“惟仁堂”，成為學校的又一亮點。
知名校友
藥學院還先後湧現了一大批中藥領域的國內外知名專家，如：全國著名的藥用植物學家丁景和教授、中藥栽培學家唐福圃教授、植物化學專家熊文淑教授、藥劑學專家郭世江教授、中藥鑑定學專家范崔生教授、中藥藥理學專家陳奇教授、中藥炮製學專家龔千鋒教授和天然藥物化學專家羅永明教授等。
