醫療設備
全院職工總數924人，其中衛技人員652人，高、中級職務者各82人和198人。醫院有職能科室11個，臨床專科9個，醫技科室9個，其中重點科室3個。99年全年門診量144921人次，收住院病人數4501人次。
該院始建於1947年，前身為衛生部南京精神病防治院，是我國第一所國立神經精神病專科醫院。解放後更名為華東精神病防治院和南京神經精神病防治院。現名為南京腦科醫院，南京醫科大學附屬腦科醫院，隸屬於南京市衛生局領導。
南京醫科大學精神病學、神經病學、醫學心理學三個教研室設在該院。醫院承擔南京地區三所高等醫學院校和一所護校的教學和臨床實習任務，還是衛生部精神醫學、兒童精神醫學培訓基地，是省衛生廳神經內科、腦電圖、腦立體定向與功能神經外科教學基地，多年來，為全國各地培訓了專業技術人員2000餘名。1991年和1993年國家教委先後確定我院為神經病學和精神衛生學碩士研究生學位點。
取得成績
南京神經精神病學研究所是1984年南京市人民政府批准設在南京腦科醫院的神經精神病學研究機構，下設15個研究室。建所12年來，在翟書濤教授的主持下，開展神經精神病學的套用基礎和臨床研究，從94年承擔國家、省、市級別及南京醫科大學科研項目20項。"八五"以來共獲科研成果42項，獲省部級獎5項。
1999年，該院被衛生部、國家中醫藥管理局、中國人民解放軍總後衛生部授予全國“百佳醫院”稱號，被衛生廳評為“十佳醫院”。被省衛生廳、省中醫藥管理局、省人事廳授予“江蘇省衛生系統先進集體”稱號，被南京市衛生局授予“白求恩杯競賽”第一名、“十佳醫院”、“花園式醫院”等。
