主要任務是：
組織或承擔水利與國民經濟和社會發展的關係，以及水利發展戰略等重大課題的研究，為中、長期水利改革與發展提出對策性建議。
圍繞水利中心工作，組織或承擔水利政策法規重大課題研究，提出政策建議和意見。
負責水利經濟研究工作，組織或承擔水利經濟領域內重大課題的研究，提出政策建議和意見。
參與水利政策法規規劃和實施計畫的制定，組織推動水利系統政策經濟研究工作，承擔部委託的政策經濟研究課題的立項預審查和成果評審，對有關政策經濟法規實施情況進行跟蹤調查，提出意見和建議。
開展水利政策、經濟的信息研究和水利科技信息開發、文獻檢索和查新工作，為水利巨觀發展戰略和政策經濟研究工作提供信息、文獻和技術支持。
參與水利信息信息化規劃工作，參與和承擔有關水利信息資源的建設和管理。
開展水利政策、經濟、法制等有關方面的國際學術交流與合作。
面向社會和水利行業開展水利軟科學及工程建設等諮詢服務。
承擔部委託的及中心所辦刊物的組稿、編輯及發行。
承辦部交辦的其他工作。
水利部發展研究中心擁有一支實力較強、專業齊全的科研隊伍，有豐富的科技文獻館藏和較為齊全的科研基礎設施，在水利政策、法規、經濟研究和水利水電科技信息開發與研究等領域內有著豐富的經驗和較強的競爭力，是水利系統目前唯一的政策經濟研究和決策諮詢機構。
