內容簡介
比較基因組學基礎
近些年來，基因組學研究技術得到了快速發展。隨著全基因組測序不斷大規模地進行，生命科學領域的研究也隨之翻開了嶄新的一頁。龐大的基因組數據信息源源不斷地從一系列新技術中產生，而且未來還會進一步呈指數倍增長。但海量的信息無法直接促進我們對生命本質的解讀，探索對這些信息進行解析的方式已成為這一時代生命科學研究最大的挑戰之一。機遇與挑戰同在，豐富的信息量、廣泛的涉及內容，結合迅猛發展的計算機、網路技術，“生物信息學”孕育而生。比較基因組學是其中最引人矚目的領域，它通過對不同物種的基因組數據進行比較分析，揭示彼此的相似性和差異性，以了解不同物種間進化上的差異。綜合這些信息能進一步幫助我們了解物種形成的機制、基因或基因組上非編碼區的功能。進行基因組比較分析時，研究並不僅限於基因編碼區，還擴展到對序列相似性的分析、基因位置的比較、基因編碼區長度或外顯子數的變異、基因組上非編碼區的比例、進化關係較遠的物種間高度保守區域的比較分析等等（例如從最簡單的細菌到非常複雜的人類基因組之間的比較）。
此前已有多部論述生物信息學資源信息（資料庫和工具）、分析方法、算法構建等相關內容的學術專著，但是仍然缺乏一本深入淺出地向廣大研究生、科技工作者介紹比較基因組學基本原理、方法及研究進展的專著。本書的出版彌補了這一空缺。本書並非旨在提供比較基因組或其他計算生物學相關領域全面的資料信息。儘管進行比較基因組學分析時要面對眾多不同的數學模型、方程式和算法，但本書並沒有過多涉及數學、統計學和計算機學的問題。這本書主要是想傳達科學研究中思考問題的方法，這在從事計算生物學研究尤其是其中最令人矚目的比較基因組學研究時非常重要。本書還對比較基因組學的研究進行了全景式的介紹，對其發展歷史和基本概念進行了梳理。
作者簡介
馬希特賈恩，出生於莫斯科，畢業於莫斯科國立大學，現任美國堪薩斯城Stowers 醫學研究所生物信息學中心主任暨堪薩斯大學醫學中心微生物學教授。
目錄
前言
1.計算基因組學時代的來臨
2.序列相似性比較
3.相似等於同源嗎
4.比較基因組學前奏：來自病毒的重大研究進展
5.比較基因組研究實際情況之一：進化過程中蛋白質序列變異具有較強的回復陸
6.比較基因組研究實際情況之二：存在分子水平上的功能趨同
7.基於基因組信息的功能預測和新陳代謝系統重建：以同源性為基礎的方法
8.功能預測和新陳代謝系統重建：不以同源性為基礎的方法
9.結構基因組學：它向我們傳達了關於生命的哪些信息
10.究竟存在多少類蛋白質家族
11.全基因組時代基於系統發育的進化推斷
12.兩個關於進化的故事
13.最小而有效的基因組及祖先基因組
14.比較基因組學與系統生物學
參考文獻
索引
