歷史沿革
1980年12月22日江西省農委、省農林墾殖廳根據“全省自然保護區區劃會議”精神，以《關於江西省自然保護區區劃和建設的報告》建議省政府：在全省建立武夷山等6個自然保護區。
1981年03月06日江西省人民政府《批轉省農委、省農林墾殖廳關於江西省自然保護區區劃和建設問題的報告》同意：在全省建立武夷山等6個自然保護區。
1981年05月06日 贛政發[1981] 22號文批准，成立武夷山自然保護區，隸屬於省林業廳，核定編制人數60人。
1982年05月在中共上饒地委、行署的直接領導下，江西省武夷山自然保護區管理處組建完成，開始工作。管理機構設在鉛山縣桐木關。
1983年05月 經相關各方協商：武夷山自然保護區四至確定，總面積為4572hm2。
1983年08月15日 鉛山縣人民政府按照劃定的自然保護區山界，將林權證發給保護區。
1983年10月15日 贛編辦發[1983] 69號文調整編制，減少編制5名，調整後編制55 名。
1984年01月 《江西省武夷山自然保護區管理規定》（試行）制定完成。
1984年05月30日 《江西省武夷山自然保護區管理總體任務設計書》劃定黃崗山、余家源2個核心區，面積2649 hm2，占總面積的58%。
1992北京“中國自然保護區優先領域研討會”上被評為中國40個具有國際保護意義的自然保護區。
1995年 經林業部、全球環境基金批准，武夷山保護區被列為“全球環境基金（GEF）———中國自然保護區管理”項目保護區。
2001年02月 鉛山縣人民政府確認：將武夷山保護區周邊林地11435 hm2劃為保護區，使保護區的管護面積達到16007 hm2。
2002年7月經國務院國辦發（2002）34號文批准晉升為國家級自然保護區。
2002年10月28日 贛編辦發[2002]165號文同意江西省武夷山自然保護區管理處更名為江西武夷山國家級自然保護區管理局。
2002年被國家林業局授予全國自然保護區“先進集體”。
2003年被江西省野生動植物保護管理局授予全省野生動植物管理和自然保護區建設“先進集體”，2001－2003年度全省森林防火工作“先進單位”，閩浙贛毗連地區第四聯防區護林防火“先進單位”。
2004年加入中國人與生物圈網路、同年被命名為首批“全國林業科普教育基地”。
江西武夷山國家級自然保護區位於江西省東部，鉛山縣南沿，武夷山脈北段西北坡，位於北緯27°48′11″——28°00′35″，東經117°39′30″——117°55′47″之間。
保護面積
保護區總面積由建立之初的4572 hm²擴大至16007hm²，跨鉛山縣一鎮一鄉三林場，其中：核心區面積4835hm²，占保護面積的30.2%；緩衝區面積2021hm²；實驗區面積9151hm²。
自然環境
氣候
自然保護區江西武夷山國家級自然保護區位於亞熱帶東部季風區，年均氣溫為14.2℃，年均降水量2583mm，最高達3544mm，是江西降水量最高的地方，年平均日照時數964h，年均蒸發量778㎜，相對濕度年平均84%。
植被
江西武夷山國家級自然保護區森林覆蓋率92.7%，活立木蓄積量139.5萬立方米，喬木林分平均立木蓄積108.4立方米/公頃，核心區、緩衝區林分平均立木蓄積226.4立方米/公頃，是全國平均數的3倍，江西平均數的6.5倍。保護區內特有的植物分布呈明顯垂直帶狀，從低海拔至高海拔依次為毛竹林、常綠闊葉林、常綠落葉闊葉混交林、針闊葉混交林、針葉林、山頂苔蘚矮林、山頂灌叢草甸等。
保護對象
屬自然生態系統類自然保護區，主要保護對象為：亞熱帶常綠闊葉林及其森林生態系統，
動物
脊椎動物有418種，哺乳動物8目25科77種，占江西分布種數的53.1%；兩棲動物2目8科25種，占江西分布種數的62.5%；爬行動物3目9科57種，占江西分布種數的74%；魚類3目9科36種，占江西分布種數的17.6%。
昆蟲已鑑定的有15目127科1329種，占江西省已知的森林昆蟲的22.5%。
植物
高等植物有2829種（含種以下單位，下同），占江西分布種數的55.4%。其中苔蘚植物68科276種；蕨類植物41科248種；裸子植物6科27種；被子植物177科2278種，此外還查明大型真菌22科61種。保護區內先後發現瘤突條大葉蟬、武夷曼蝽、蝽武夷真恙蟎、武夷山石楠、武夷山小檗、武夷華千里光、武夷山懸鉤子、鉛山懸鉤子、中華直蒴苔9個新種和武夷山花楸、武夷山空心泡、無刺空心泡3個新變種。
管理機構
江西武夷山國家級自然保護區管理局為正處級單位，屬全額撥款事業單位，編制60人，經費列入省財政，直屬江西省林業廳領導。
研究成果
由中國科學院動物研究所和中國動物學會聯合主辦的《動物學雜誌》，2011年10月份出版的期刊（2011年第46卷第5期第66-78頁）中刊登了武夷山保護區專業技術人員撰寫的《江西武夷山國家級自然保護區鳥類多樣性調查》。
