細菌性疾病
採用內服藥與外用藥相結合的治療方法，效果較好。常用的內服藥主要有：土黴素、氯黴素、大蒜素、氟哌酸、磺胺類、酵母粉、利胃散、食鹽、生石灰、漂白粉、呋喃類、抗菌素、含氯消毒劑、中草藥等。
目前，細菌性疾病危害大，引起嚴重死亡的是細菌性敗血症和脫粘病。
治療方法
（1）用黃蓮15毫克～20毫克/升+大黃3毫克～5毫克/升+黃芩3毫克～5毫克/升+五倍子4毫克～5毫克/升合劑，煎汁連潑2天～3天；
（2）優碘1毫克～2毫克/升+呋喃唑酮3毫克～4毫克/升潑灑，連用2天；
（3）氟哌酸1克～2克/公斤飼料，或環丙沙星0.5克～1.0克/公斤飼料投餵2天～3天，效果較好。上述兩種疾病，從白仔至黑仔苗飼養階段要細心注意觀察，一旦發現病兆，就應及時治療。嚴重時治癒時間長，短者半個多月，長者1月～2月，易造成大批死亡。發病時間過長會影響鰻魚生長，三類苗比例可能因此增多。
寄生蟲病
小瓜蟲病
（1）用孔雀石綠0.2毫克/升浸浴12小時～24小時。
（2）"滅蟲靈"2號1毫克～2毫克/升全池潑灑，連用2天～3天。
（3）硝酸亞汞0.08毫克～0.1毫克/升全池潑灑。
擬指環蟲病
（1）用複方甲苯咪唑0.6毫克～0.8毫克/升藥浴12小時～24小時。
（2）"滅蟲靈"2號1毫克～2毫克/升浸浴12小時～24小時。
車輪蟲病
（1）用硫酸銅和硫酸亞鐵合劑0.7毫克/升藥浴18小時～24小時。
（2）"殺蟲靈"0.2毫克～0.3毫克/升藥浴12小時～24小時。
毛腹蟲病
（1）用"百蟲殺"2毫克～3毫克/升藥浴18小時～24小時。
（2）複方甲苯咪唑0.6毫克～1.0毫克/升藥浴12小時。
（3）"殺蟲靈"0.2毫克～0.3毫克/升藥浴12小時～24小時。
粘孢子蟲病
（1）用"治孢靈"5克～6克/公斤飼料，熱水浸泡5小時～6小時後，取藥汁拌合飼料連餵5天～7天。
（2）"治孢靈"3毫克～5毫克/升熱水浸泡，取汁連潑3天～5天。
魚波豆蟲病
（1）用硫酸銅和硫酸亞鐵合劑0.7毫克/升藥浴12小時～24小時。
（2）食鹽7‰～8‰浸浴18小時～24小時。
（3）福馬林30毫克～50毫克/升浸浴12小時～24小時。
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