1979年---2003年7月,歷任中國社會科學院財貿經濟研究所《財貿經濟》編輯部技術編輯、助理編輯、編輯;《財貿經濟》編輯部副主任(副處級)。
2003年8月起,任中國社會科學院財政與貿易經濟研究所辦公室主任(正處級)。
2004年3月任中共中國社會科學院財政與貿易經濟研究所委員會辦公室主任。
2005年1月當選中共中國社會科學院財政與貿易經濟研究所委員會委員。
2008年11月任中國社會科學院財政與貿易經濟研究所所長助理。
2009年12月任中國社會科學院財政與貿易經濟研究所副所長(副司局級)。
2011年12月任中國社會科學院財經戰略研究院副院長、紀委書記(副司局級)。
2015年6月任中國社會科學院服務中心(中國社會科學院服務局)局長(正司局級)。
2017年7月21日中國社會科學院黨組免去林旗同志的服務中心主任職務。
2018年1月退休。