基本情況
個人簡歷
1995.9-1999.7:華南農業大學 畜牧 學士
1999.9-2002.7:華南農業大學 動物遺傳育種 碩士
2002.9-2005.7:華南農業大學 動物遺傳育種 博士
2003.8-2003.10:華中農業大學動物遺傳國家重點實驗室學習基因組相關技術
2006.1-2009.8 華南理工大學 講師
2006.5-2006.8 中國醫學科學院生物技術研究所進修
2009.9-2015.8 華南理工大學 副教授
2015.9-至今 華南理工大學 教授
主授課程
主講《生物化學》、《分子生物學》、《系統生物學》等課程。
主要科研方向與興趣
科研方向
博士期間利用比較基因組學將21個功能基因定位在豬繁殖性狀的QTL區間。2006年1月至2009年8月,主要從事工業酶理性設計和改造研究,通過蛋白質結構生物信息全理性設計將木糖還原酶依賴的輔酶從NADP改成NAD。2009年9月定職為華南理工大學副教授,主要從事功能基因組學和生物信息學的研究。參與了華南新藥創製中心、華大、華南理工大學等單位合作的食蟹猴和中國恆河猴基因組項目,並以重要作者身份在《Nature Biotechnology》發表論文。迄今為止,共發表論文40餘篇,其中SCI論文20餘篇。參與編寫《食品與基因工程》論著,3.5萬字。主持或完成了2項國家級、2項省級、1項市級和3項校級科研項目,參與了多項國家自然科學基金和863項目。主講《生物化學》、《分子生物學》、《系統生物學》等課程。
研究興趣
(1)重大疾病潛在生物標誌物和靶標研究:隨著組學技術的快速發展,國際積累了海量的組學數據,利用交叉學科的思維和系統生物學方法從各個層次去揭示疾病發病機制,鑑定其潛在的生物標誌物和靶標,課題組目前主要在2型糖尿病和結核感染等方面開展研究工作;
(2)高通量基因組技術在疾病預測預防中的套用:利用高通量組學技術在重大老年病及腫瘤的預測、預防上做些前瞻性的研究。
主要科研項目與論文
主持項目:
1.主持廣東省自然科學基金:木糖還原酶和木糖醇脫氫酶定向分子進化研究(2006-2009)
2.參與國家“863”項目:藥物代謝酶SNPs與藥物的類藥性一體化預測軟體的研究與開發(2008-2011)
3.主持廣東省科技計畫項目:食蟹猴免疫和疾病相關基因庫及MHC等位基因信息庫的建立(2010-2012)
4.主持華南理工大學中央高校基本科研業務費重點項目:食蟹猴2型糖尿病模型構建的遺傳標記研究(2011-2012)
5.十二五重大專項(副組長):人類重大疾病靈長類動物模型資源平台的建設(2011-2013)
6.主持廣東省科技計畫項目:食蟹猴2型糖尿病模型構建和評價體系的建立和完善(2012-2013)
7.主持華大華工創新基金:2型糖尿病發病進程中的分子機制和干預治療的靶標篩查研究(2013-2015)
8.主持國家自然科學基金:食蟹猴2型糖尿病模型發病進程的分子機制研究(2014)
9.參與國家自然科學重點基金:金屬礦區硫素生物地球化學循環過程中的關鍵問題(2014-2018)
10.參與科技支撐項目:靈長類動物人類重大疾病模型的研究與示範(2014-2016)
11.參與科技支撐項目:實驗動物感染病原的MFIA、PCR-HRM、基因晶片檢測診斷和遺傳質量SNP檢測的新技術方法研究和套用(2015-2017)
發表論文:
1.Li Y, Zheng H, Luo R, Wu H, Zhu H, Li R, Cao H, Wu B, Huang S, Shao H, Ma H,Zhang F, Feng S, Zhang W, Du H, Tian G, Li J, Zhang X, Li S, Bolund L,Kristiansen K, de Smith AJ, Blakemore AI, Coin LJ, Yang H, Wang J, Wang J. Structural variation in two human genomes mapped at single-nucleotide resolution by whole genome de novo assembly.Nature Biotechnology. 2011,29(8):723-730(SCI IF=31.1)
2.Yan G, Zhang G, Fang X, Zhang Y, Li C, Ling F, Cooper DN, Li Q, Li Y, van Gool AJ, Du H, Chen J, Chen R, Zhang P, Huang Z, Thompson JR, Meng Y, Bai Y, Wang J, Zhuo M, Wang T, Huang Y, Wei L, Li J, Wang Z, Hu H, Yang P, Le L, Stenson PD, Li B, Liu X, Ball EV, An N, Huang Q, Zhang Y, Fan W, Zhang X, Li Y, Wang W, Katze MG, Su B, Nielsen R, Yang H, Wang J, Wang X, Wang J. Genome sequencing and comparison of two nonhuman primate animal models, the cynomolgus and Chinese rhesus macaques.Nature Biotechnology. 2011, 29(11):1019-23.(SCI IF=31.1)
3.Du H, Hu H, Meng Y, Zheng W, Ling F, Wang J, Zhang X, Nie Q, Wang X. The correlation coefficient of GC content of the genome-wide genes is positively correlated with animal evolutionary relationships. FEBS Letter. 2010, 584(18):3990-4(SCI IF=3.5)
4.Du HL, Chen J, Cui JX, Wang XN and Zhang XQ. Polymorphisms on SSC15q21-q26 containing QTL for reproduction in swine and its association with litter size. Genetics and Molecular Biology, 2009, 32(1):69-74(SCI)
5.Du HL, Chen J, Zhang YS, Zhang XQ. Molecular cloning, mapping, and polymorphism of the porcine SCG2 gene. Biochem Genet, 2008, 46 (3): 369-379.(SCI)
6.Du HL, Chen J, Cui JX, Zhang YS, Yerle M, Milan D, Zhang XQ. Radiation hybrid mapping and sequence analysis of 21 genes on porcine chromosome 15. Anim Genet, 2006, 37(2):181-183.(SCI IF=2.6)
7.Zeng QK, Du HL(並列第一),Wang JF, Wei DQ, Wang XN, Li YX, Lin Y. Reversal of Coenzyme Specificity and Improvement of Catalytic Efficiency of Pichia Stipitis Xylose Reductase by the Rational Site-directed Mutagenesis. Biotechnol Lett. 2009, 31(7):1025-9(SCI)
8.Fang M, Du H, Hu Y, Zhou X, Ouyang H, Zhang W, Jia X, Li J, Wang Y, Nie Q, Zhang X. Identification and Characterization of the Pig ABIN-1 Gene and Investigation of its Association with Reproduction Traits. J Genetic. 2011, 90(1):e10-20
9.Zhang YS, Du HL, Chen J, Yang GF, Zhang XQ. Porcine growth differentiation factor 9 gene polymorphisms and their associations with litter size. J Genet Genomics, 2008, 35 (3): 163-169.(SCI)
10.Cui JX, Du HL, Liang Y, Deng XM, Li N, Zhang XQ. Association of Polymorphisms in the Promoter Region of Chicken Prolactin with Egg Production.Poultry science. 2006, 85(1):26-31.(SCI Impact Factor=2.1)
11.Zhen FS, Du HL, Xu HP, Luo QB, Zhang XQ. Tissue and allelic-specific expression of hsp70 gene in chickens: basal and heat-stress-induced mRNA level quantified with real-time reverse transcriptase polymerase chain reaction. British Poultry science. 2006, 47(4):449-455.(SCI Impact Factor=1.3)
12.Jin X, He M, Ferguson B, Meng Y, Ouyang L, Ren J, Mailund T, Sun F, Sun L, Shen J, Zhuo M, Song L, Wang J, Ling F, Zhu Y, Hvilsom C, Siegismund H, Liu X, Gong Z, Ji F, Wang X, Liu B, Zhang Y, Hou J, Wang J, Zhao H, Wang Y, Fang X, Zhang G, Wang J, Zhang X, Schierup MH, Du H, Wang J, Wang X. An effort to use human-based exome capture methods to analyze chimpanzee and macaque exomes. PLoS One. 2012;7(7):e40637.通訊作者(SCI IF=4.0)
13.Chen J, Meng Y, Zhou J, Zhuo M, Ling F, Zhang Y, Du H, Wang X. Identifyingcandidate genes for Type 2 Diabetes Mellitus and obesity through gene expression profiling in multiple tissues or cells. J Diabetes Res. 2013, 2013:970435. doi:10.1155/2013/970435.通訊作者(SCI IF=3.5)
14.Zhou J et al. ComparativeMicroRNA Expression Profiles of Cynomolgus Monkeys, Rat and Human Reveal miR-182Involved in T2D Pathogenic Processes. J Diabetes Res.2014,2014:760397通訊作者(SCI IF=3.5)
15.Wang Y, et al. Identifying Human Genome-wide CNV, LOH and UPD by Targeted Sequencing of Selected Regions.PLoS One.2015, 10(4):e0123081通訊作者
16.Meng Y, et al. Genome-wide Analysis of Positively Selected Genes in Seasonal and Non-seasonal Breeding Species.PLoS One.2015, 10(5):e0126736通訊作者
17.Chen B, et al. A Genome-Wide mRNA Screen and Functional Analysis Reveal FOXO3 as a Candidate Gene for Chicken Growth. PLoS One. 2015, 10(9):e0137087.通訊作者
18.杜紅麗,王靖方,曾琦鍇,凌飛,魏冬青,林影,王小寧.木糖還原酶定點突變設計的生物信息學分析.華南理工大學學報(自然科學版), 2008, 36(12):122-127.
19.杜紅麗,崔建勛,張細權.利用DNA池和測序技術快速篩查候選效應單倍型.農業生物技術學報,2008, 16(2):281-285
20.曾琦鍇,林影,翟志臣,林小瓊, 杜紅麗.木糖還原酶Lysine270突變的理性設計.華南理工大學學報(自然科學版), 2009,37(6):79-83(通訊作者)
21.鄭維豪,杜紅麗,林志強,閃瑩,王小寧.豬肺泡巨噬細胞感染PRRSV進程中差異表達基因及基因功能富集分析.基因組學與套用生物學,2010,1039-1046(通訊作者)
22.鄭維豪,林志強,卓敏,杜紅麗,王小寧.抗流感病毒小RNAs研究進展.遺傳.2012, 34(5):526―532(通訊作者)
23.中國圈養食蟹猴TrimCyp 基因頻率.田帥,蒙裕歡,柳明玉,孫飛,陳軍輝,杜紅麗,王小寧. 動物學研究 2013,34(2): 97−102(通訊作者)