1935年3月，紅四方面軍離開川陝邊區根據地向川康兩省邊境地區轉移，第二年10月在甘孜一帶同紅二方面軍會合，到達甘肅後，紅四方面軍的部隊兩萬餘人渡過黃河，組成西路軍，向新疆進發。12月，在甘肅省永昌城與敵展開激戰，紅軍損失慘重，李一才也被敵人俘虜。當時戰鬥還在進行中，敵人匆忙地刨了一個坑，把李一才推進去活埋，戰鬥結束後，李一才從松淺的土坑中掙扎著爬了出來，在地下滾著行走了一里多路，被一個拾糞的農民發現後解開繩索。後來，他打聽到黨中央和工農紅軍在陝北建立了根據地，便把長長的頭髮梳成髻，裝扮成農民婦女，一路要著飯向東方走，終於在1937年春找到了紅軍。
抗日戰爭爆發後，李一才隨八路軍第一二九師挺進敵後，轉戰太行，任涉縣抗日游擊大隊長。在粉碎日軍九路圍攻的戰鬥中，他身負重傷，右臂和鎖骨被打斷，被送進第一二九師衛生部醫院，因傷勢很重，加上當時醫院的醫療條件甚差，他的病情一天天惡化，竟至終日昏迷不醒，水米不進，醫院為他準備好了衣服和棺木、部隊領導也紛紛前來向他告別，但在一位老醫生的精心治療和護理下，他竟奇蹟般地活了下來。出院後，組織上考慮到他的身體已經殘疾，就把他留在衛生部工作，任第三衛生所教導員，後來三所擴大為醫院，他任政治委員，活動地點在太行五分區一帶。1942年，抗日戰爭進入極其艱苦的階段，日軍糾集重兵，對太行山抗日根據地發動了兩次“駐晉日軍總進攻”，左權等許多領導同志壯烈犧牲。在這一時期，李一才常在手中提著六輪手槍，帶領輕傷員上山打游擊，掩護醫院安全轉移。
1946年，李一才被調到晉冀魯豫軍區第六縱隊衛生部任政治委員，1947年劉鄧大軍挺進大別山，在艱苦的環境中，他的舊病復發，回到太行休養，病勢稍愈後，領導上建議他在留守處工作，他執意不肯，堅持要上前線去，但不久病情急劇惡化，於1948年10月30日在長治市病逝。
