2002到2009年間,擔任歐洲生物信息學研究所(EBI)資料庫套用團隊主任,負責開發與管理被廣泛使用的生物資料庫,比如EMBL核酸資料庫、UniProt蛋白質知識庫以及InterPro蛋白質二級結構資料庫。在以後的2年裡,擔任EBI資料庫研究與開發團隊的主任,注重大規模生物學數據的管理、整合與分布方面的研究與開發。
2011年10月全職回到中國,在太倉生命信息研究所擔任常務副所長,暨生物信息學中心主任,著重於建立中國生物信息學服務平台方面的工作。在國內有關學術單位擔任兼職教授,參與國家蛋白質組學與生物信息學有關課題。