設有科室
辦公室、人事教育科、財務規劃科、寄生蟲病防治科、檢驗中心、急傳科、免疫規劃科、食品、環境監測科、職業、學校衛生科、地方病防治科、愛滋病性病科、信息管理科、慢性非傳染病防治科、消毒殺蟲科、健康教育科、康復治療中心、質量管理科、技術服務部。歷史背景
昭通市疾病預防控制中心的前身昭通地區衛生防疫站建於1959年7月。2001年昭通撤地設市更名為昭通市衛生防疫站。2002年經昭通市人民政府批准撤銷市衛生防疫站，組建市疾病預防控制中心，並加掛市衛生檢驗中心牌子。2003年6月13日昭通市疾病預防控制中心掛牌成立。昭通市疾病預防控制中心是昭通市人民政府實施疾病預防控制與公共衛生技術管理和服務的公益事業單位，具體實施政府對疾病預防控制以及衛生監督執法技術支持的職能，不再承擔衛生監督執法職能，是集疾病預防控制、公共衛生監測、衛生檢驗、衛生信息等為一體的疾病預防控制中心。中心職能
一、疾病預防與控制對影響人群生存的環境衛生質量和生命質量的危險因素進行監測，對各種傳染病、地方病、寄生蟲病、慢性非傳染性疾病、職業病、公害病、學生常見病及意外傷害、中毒等進行流行病學監測，並制定預防控制對策，為衛生行政部門決策提供科學依據；擬訂並實施疾病預防與控制工作方案，並進行質量和效果評價。
二、監測檢驗與評價
受衛生行政部門認定，承擔衛生監督監測檢驗、預防性健康檢查、健康相關產品的技術審核和衛生質量檢驗鑑定；對新建、改建和擴建建設項目的選址、設計和竣工驗收進行衛生學評價。
三、健康教育與促進
開展健康教育與健康促進，參與社區衛生服務工作，促進社會健康環境的建立和人群健康行為的形成。
四、套用研究與指導
進行套用性科學研究，開發和推廣先進技術；負責人員培訓技術規範和措施的實施；承擔愛國衛生運動中與疾病控制有關的技術指導。
五、技術管理與服務
對傳染性疾病的發生、流行和中毒、污染等事件進行調查處理，為救災防病和重大公共衛生問題提供技術支持；負責預防用生物製品的使用和管理；承擔疾病預防控制及有關公共衛生信息的報告、管理和預測預報，向社會提供相關的預防保健信息、健康諮詢和預防醫學診療等專業技術服務。
六、臨床診斷與治療
承擔各類傳染病、職業病病人的診斷、治療、康復等醫療服務工作。
機構職能
1、辦公室負責對中心業務和綜合事務的協調、服務與管理，為中心領導做好參謀；負責中心計畫管理、綜合目標責任制、制度管理、事務公開及信息管理；負責中心會議管理、綜合文秘、檔案、文印、檔案資料收發、車輛管理等管理工作；協助有關科室做好中心內外各項突發事件處理和協調管理工作；負責基建和職工住房的管理；負責冷庫、通訊設施等維護管理；負責中心環境衛生、綠化的規劃管理。完成上級和中心交給的其他工作。負責中心行政、業務工作的全面質量管理；負責實驗室認可質量管理體系檔案的起草、修訂、督促檢查等；負責中心內、外質量問題投訴和質量事故的處理等事宜；負責中心科研項目、繼續教育和崗位培訓等。
2、人事教育科
負責中心人事安排、調入調出、培訓教育。人事工資和職稱評定等工作。
3、財務規劃科
負責中心財務預算、決算和工資等日常經費支出，往來帳款及疫苗、藥品財務管理；負責中心固定資產、消殺藥品、低值易耗品的計畫、採購、倉儲、調撥、發放、報廢等管理；
4、急性傳染病防治科
研究制訂全市傳染病的預防控制和免疫工作規劃，開展流行病學調查、疫情監測、報告和預報,對傳染病暴發等重大疫情進行調查和控制；組織實施預防接種，生物製品運行管理和預防接種異常反應的現場處理。負責全市愛滋病、性病防治工作的技術指導、組織規劃和宣傳教育，協助做好全市愛滋病初篩實驗室質量控制工作。
5、慢性非傳染病防治科
組織、指導本市肺結核病、慢性非傳染性疾病以及血吸蟲病、寄生蟲病等地方病防制工作，制定防治策略和措施；指導基層業務建設、培訓專業人員，幫助解決技術上的疑難問題；深入基層參加具體業務活動，有計畫有重點地開展防制工作，控制相關疾病的流行，降低人群的感染率，減少疾病發生，降低死亡率。麻風病監測與防治工作。
6、職業、學校衛生科
組織開展職業衛生檢測、職業衛生體檢、職業危害因素監測與評價及衛生防護、消毒殺蟲等技術指導工作，對新建、改建和擴建建設項目的選址、設計和竣工驗收進行衛生學評價。負責職業衛生相關資料、信息的收集、分析、評價及報告，為職業病診斷提供相關依據；指導基層開展相關衛生業務工作。學生健康體檢與監測。組織開展食品、學校衛生檢測、學校衛生體檢與評價及衛生防護，對新建、改建和擴建的學校的選址、設計和竣工驗收進行衛生學評價。負責學校衛生相關資料、信息的收集、分析、評價及報告，為學生常見病防治和學生健康教育提供相關依據；指導基層開展相關衛生業務工作。
7、環境衛生監測科
負責環境監測，營業員體檢、健康證辦理工作。
8、健康教育科
負責全市食品、公共場所從業人員的衛生知識培訓和健康諮詢；製作、收集和編髮衛生宣傳文字、聲像等健康教育材料。配合中心的業務工作和衛生宣傳日，運用現代傳媒和手段，有組織、有計畫地開展了各項健康教育宣傳活動，編輯製作相關健康教育圖文聲像資料。兼管負責實驗室認可及檢驗樣品收發、送檢、出證等管理。
9、檢驗中心
按照計量認證要求，對健康相關產品進行微生物、理化等檢驗，為社會、企業和個人提供公正、準確、及時的檢驗檢測數據；配合職能部門做好食物中毒、暴發疫情等突發性公共衛生事件的檢驗檢測工作，為行政部門制定正確的公共衛生工作措施提供科學依據。 10、愛滋病、性病科
對全市愛滋病監測管理工作及對愛滋病的確診、性病監測、及疫情上報工作。
11、康復治療中心
採用先進、科學、可靠的檢測技術和治療設備，診治各種皮膚病及各類性病，對病人實行保密治療。組織開展預防性健康體檢及肺結核病、狂犬病、肝病、地方病、職業病等相關疾病診斷治療工作；為社區居民提供醫療衛生服務。以及各種疫苗的接種、兒童計畫免疫接種。
12、計畫免疫規劃科
對全市計畫免疫疫苗冷鏈管理、配發等工作。
13、質量管理科
對全中心相關科室檢驗進行嚴格審核，確證。
