職責
開展司法鑑定科學技術理論研究，承擔國家法務部、科技部和自治區等有關部門重點科技攻關項目，積極推進司法鑑定科學技術創新；研究制定適合新疆特點的司法鑑定技術標準、技術規範；承辦公檢法等司法機關委託的重大、疑難、複雜等案件的鑑定及經社會鑑定機構多次鑑定仍有爭議的鑑定事項；為新疆各級政府應急防範體系提供相關科學技術支持，對社會鑑定機構進行技術指導等。
其他
一、職稱評審。制定相應的管理辦法和制度，為疆內司法鑑定機構及專業技術方面提供“職稱評定、能力驗證、認證認可、學術科研”服務項目。
二、教育培訓。依據有關法律、法規，開展教育培訓，培養司法鑑定骨幹和高端人才，負責宣傳和司法鑑定技術信息工作。
三、專業研究。開辦研究所省級學術性刊物<<新疆司法鑑定研究>>，主要以學術研究、論文發表研討、重大疑難案例分析，研究專業學術指導、制度與法規等進行交流和探討。
四、合作交流。開展國內外的學術交流與合作，積極主辦司法鑑定領域學術研討會並組團參加全國業務領域學術會議。
五、業務指導。承擔鑑定機構新設立和鑑定類別增項技術層面審核，成立專家委員會，參與疑難重大案件的專家會審、參與突發事件和自然災害事件的公共服務。
六、負責所屬司法鑑定中心的管理工作，組織協調相關事務，指導、協調各中心黨組織建設和黨員隊伍管理工作。
內設機構
內設黨辦、辦公室、《新疆司法鑑定研究》編輯部、科研學術部、質量監督部等科室。
領導介紹
劉愛軍，男，漢族，所長，主持研究所全盤工作。
孟 灩，女，漢族，副所長，分管研究所黨建、辦公室、人事、宣傳聯絡等工作。
遠麗輝，男，漢族，副所長，分管研究所技術工作。
技術支撐
2014年自治區司法廳黨委從新疆多民族、多元化的特殊人文地域實際出發，提出具有西北特點的司法鑑定工作發展新思路，確立了新疆司法鑑定工作“在新疆做活、在西北做強、在全國做精，努力打造司法鑑定行業的航母”的發展目標，以及“求實、求深、求精、求質”的發展原則。自2014年底至今在自治區司法廳黨委的科學指導和幫助下，先後建立隸屬研究所管轄的法醫、農林牧、綜合、經濟、物證等司法鑑定中心，涵蓋法醫、建設工程、礦產資源、物證、交通、會計、涉稅、價格評估、農林畜牧業、園林、農林水利工程等司法鑑定全行業領域，初步建成統一、規範、科學、權威、公正的“一所五中心”司法鑑定機構布局。
模式
2010年按照《全國人大常委會關於司法鑑定管理問題的決定》和法務部《關於推進公共法律服務體系建設意見》的要求，自治區司法廳黨委著眼於深化新疆司法鑑定體制改革發展的總體框架，組建成立的全國第二家、省級第一家司法鑑定科研中心，涵蓋法醫、建設工程、礦產資源、物證、交通、會計、涉稅、價格評估、農林畜牧業、園林、農林水利工程等司法鑑定全行業領域的機構，它的改革與發展有利於推動我區構建統一、客觀、科學、公正的司法鑑定體制具有重要意義，切實改變我區以往司法鑑定機構點多、組織形式多樣、管理滯後等因素，整合司法鑑定優勢資源，努力開創司法鑑定事業發展的新局面，切實保證我區司法鑑定工作更加科學合理、統一規範、運行高效、監督有力，具有社會公信力，使司法鑑定工作更加貼近我區各族民眾、符合實際，不斷滿足人民民眾和司法訴訟活動的新需求、新期待。
五中心
1.司法鑑定中心：建設工程司法鑑定、修複方案及費用評估；建設工程、經濟指標鑑定與評估；環境資源損害鑑定及評估；礦產資源破壞價值鑑定及評估；房屋拆遷司法鑑定及評估；文書、痕跡(手印)鑑定等。
2.法醫司法鑑定中心：法醫臨床鑑定、法醫病理鑑定、法醫物證鑑定、法醫毒物鑑定、法醫精神病鑑定。
3.農林牧司法鑑定中心：農業、林業、畜牧業、園林及農林水利工程生產過程中損失的因果關係鑑定及價值評估；農、林、畜牧產品、農林水利工程和生產資料的質量鑑定及價值評估；農機、水利、生產資料給農、林、畜牧、園林造成的損失鑑定及價值評估;野生動、植物司法鑑定及價值評估；土地種類、面積的鑑定及價值評估。
4.經濟類司法鑑定中心：價格評估司法鑑定、會計司法鑑定、涉稅司法鑑定、房地產評估司法鑑定、工程造價司法鑑定、經濟類疑難案件的二次鑑定、綜合類涉訴司法鑑定、土地評估司法鑑定、資源性資產評估司法鑑定等。
5.物證類司法鑑定中心：痕跡物證；理化物證；微量物證；交通事故。
信息公開
通過多方努力，研究所重新構建並開通了集信息公開、公眾套用、內部管理等功能為一體的司法鑑定信息公共網站（www.xjsfjd.com），以鑑定實例、專家介紹、行業動態、工作亮點等為宣傳重點，不斷擴大社會影響力和公信力，為業務發展和宣傳做好服務。
省級期刊
為營造“百花齊放、百家爭鳴”的學術研究氛圍、打造全國省級優秀核心學術期刊，同時為全區乃至全國司法鑑定行業專業技術人員提供發表職稱評審論文的平台，研究所制定了學術徵集與對外宣傳工作獎勵實施辦法，廣泛徵集國家、自治區各級領導指示和專家教授理論文章，大力宣傳同行業優秀典型鑑定案例，積極向自治區新聞出版廣電局申報創辦省級學術期刊《新疆司法鑑定研究》（刊號0159），2016年12月第二期已出版。
能力驗證
研究所首次研發的科研項目（課題）“論環境損害司法鑑定機構設立模式”、《維吾爾文筆跡鑑定實施規範》獲得法務部國家級立項批准；
研究所司法鑑定中心獲得新疆首家“文書鑑定類”國家級實驗室資格和自治區首家自治區質量技術監督局建設工程檢驗檢測機構計量認證、自治區住建廳建設工程檢驗檢測機構資質認證；
研究所農林牧司法鑑定中心成立駐山東辦事處，內蒙及黑吉遼的設點已完成前期各項調研，計畫在適當時期進行設點運營，同時與農業部環境保護科研監測所共同啟動“948計畫·循環農業管理計量模型和分析方法引進與套用”科研項目，為不斷推進鑑定信息化建設、進一步提高鑑定管理效率奠定了堅實的基礎。
信息公開
參見自治區司法廳《新疆司法鑑定機構及鑑定人名錄》。
