此屠殺導致瑞典人對丹麥人的長期憎恨，故兩國於之後接近300年都維持敵對狀況，互相想征服對方。儘管瑞典後來逐漸取得政治和軍事上的強勢（如成功占領斯科訥），但瑞典人還是以大屠殺中的受害者自居。
瑞典政治角力
這宗慘案除了是起源於瑞典國內兩派政治勢力──支持聯合（支持由丹麥主導的卡爾馬聯合）者與反對聯合（支持瑞典獨立）者──的角力，也是反對聯合者與丹麥貴族（即克里斯蒂安國王）鬥爭的結果。反對聯合者以小斯騰·斯圖爾（Sten Sture den yngre）為首，支持聯合者則以古斯塔夫·特羅雷（Gustav Trolle）大主教為首。
克里斯蒂安入侵
當時，瑞典選出小斯騰·斯圖爾為攝政，並把特羅雷視為通敵，而把他圍困在其Stäket堡壘中。克里斯蒂安二世於是出兵救援特羅雷。但他被斯圖爾帶領的農民軍隊打敗於Vedila，只得退回丹麥。他於1518年再次出兵瑞典，但都被斯圖爾於Brännkyrka擊退。1520年，克里斯蒂安率領法籍、德籍和蘇格蘭籍僱傭兵大軍再次入侵，終於取得勝利。
1月19日，斯圖爾於Bogesund戰役中負傷而死。丹麥軍隊遂長驅直進，直迫瑞典國會成員聚集的烏普薩拉。國會議員同意只要克里斯蒂安既往不咎，並保證依照瑞典法律和傳統來管治瑞典，他們便肯效忠於他。3月31日，克里斯蒂安和丹麥樞密院答應此項條件。
斯圖爾之遺孀Kristina Nilsdotter Gyllenstierna女爵得到瑞典中部農民支持，仍然在斯德哥爾摩頑抗，並於3月19日在Balundsås擊敗丹麥軍隊。然而，她在4月6日（耶穌受難日）的烏普薩拉戰役被打敗。
丹麥海軍於5月加入戰團，使斯德哥爾摩海陸兩路受襲。Kristina雖再頑抗了4個多月，但最終於9月7日向丹麥投降，條件是她會得到赦免。11月1日，雖然瑞典法律規定選舉國王，但瑞典的代表擁戴克里斯蒂安為瑞典世襲國王，並向他宣誓效忠。
大屠殺
11月4日，古斯塔夫·特羅雷於斯德哥爾摩大教堂膏立克里斯蒂安為王，克里斯蒂安按例宣誓只以土生的瑞典人管治瑞典。他於接著3天大排筵席。
11月7日黃昏，克里斯蒂安召開私人會議，於王宮邀請了很多瑞典領導人。11月8日薄暮間，拿著燈籠和火把的丹麥士兵闖入大堂，並押走了一些人。當晚，國王其餘的賓客也被囚禁起來。這些人之前都被特羅雷大主教列為國家公敵。
11月9日，以特羅雷大主教為首的議會，以異端的罪名判處被囚的人死刑。晚上12時正，反對聯合的斯卡拉和斯特蘭奈斯大主教被押解至大廣場斬首。其後，14名貴族、3名市長、14名鎮議員和20多個斯德哥爾摩平民都被溺斃或斬首。
翌日，有更多人被處死，估計共有82人被殺。有說克里斯蒂安為了向斯騰·斯圖爾報復，起出了他和其幼子的屍體焚燒，其遺孀Kristina和其他瑞典女貴族則被囚禁于丹麥。
克里斯蒂安向瑞典民眾公告，大屠殺行為是為了避免教廷禁罰，故是合理的。但他向教宗就殺害主教致歉時，只歸咎於其軍隊為了報復而擅自行動。
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在1948年出版、芬蘭作家Mika Waltari的歷史小說《Mikael Karvajalka》中，斯德哥爾摩屠殺是一個重要情節。故事以當時身處斯德哥爾摩的年青芬蘭人Mikael Karvajalka的角度道出。
